Two-part joint model for a longitudinal semicontinuous marker and a terminal event with application to metastatic colorectal cancer data
Notice bibliographique
Résumé
Joint models for a longitudinal biomarker and a terminal event have gained interests for evaluating cancer clinical trials because the tumor evolution reflects directly the state of the disease. A biomarker characterizing the tumor size evolution over time can be highly informative for assessing treatment options and could be taken into account in addition to the survival time. The biomarker often has a semicontinuous distribution, i.e., it is zero inflated and right skewed. An appropriate model is needed for the longitudinal biomarker as well as an association structure with the survival outcome. In this article, we propose a joint model for a longitudinal semicontinuous biomarker and a survival time. The semicontinuous nature of the longitudinal biomarker is specified by a two-part model, which splits its distribution into a binary outcome (first part) represented by the positive versus zero values and a continuous outcome (second part) with the positive values only. Survival times are modeled with a proportional hazards model for which we propose three association structures with the biomarker. Our simulation studies show some bias can arise in the parameter estimates when the semicontinuous nature of the biomarker is ignored, assuming the true model is a two-part model. An application to advanced metastatic colorectal cancer data from the GERCOR study is performed where our two-part model is compared to one-part joint models. Our results show that treatment arm B (FOLFOX6/FOLFIRI) is associated to higher SLD values over time and its positive association with the terminal event leads to an increased risk of death compared to treatment arm A (FOLFIRI/FOLFOX6).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,030 | 0,033 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,005 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».