Charged Gram-positive species sequester and decrease the potency of pediocin PA-1 in mixed microbial settings
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Antimicrobial peptides (AMPs) have gained attention recently due to increasing antibiotic resistance amongst pathogens. Most AMPs are cationic in nature and their preliminary interactions with the negatively charged cell surface is mediated by electrostatic attraction. This is followed by pore formation, which is either receptor-dependent or -independent and leads to cell death. Typically, AMPs are characterized by their killing activity using bioactivity assays to determine host range and degree of killing. However, cell surface binding is independent from killing. Most of the studies performed to-date have attempted to quantify the peptide binding using artificial membranes. Here, we use the narrow-spectrum class IIa bacteriocin AMP pediocin PA-1 conjugated to a fluorescent dye as a probe to monitor cell surface binding. We developed a flow cytometry-based assay to quantify the strength of binding in target and non-target species. Through our binding assays, we found a strong positive correlation between cell surface charge and pediocin PA-1 binding. Interestingly, we also found inverse correlation between zeta potential and pediocin PA-1 binding, the correlation coefficient for which improved when only Gram-positives were considered. We also show the effect of the presence of protein, salt, polycationic species, and other non-target species on the binding of pediocin PA-1 to the target organism. We conclude that the of presence of highly charged non-target species, as well as solutes, can decrease the binding, and the apparent potency, of pediocin PA-1. Thus, these outcomes are highly significant to the use of pediocin PA-1 and related AMPs in mixed microbial settings such as those found in the gut microbiota.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».