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Enregistrement W3016145840 · doi:10.1096/fasebj.21.5.a243-c

Characterization of a CFTR construct with a C‐terminal tetracysteine sequence and its use in the visualization of trafficking pathways

2007· article· en· W3016145840 sur OpenAlexafffundabout
Firhan A. Malik, Christine E. Bear

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCystic Fibrosis Foundation Therapeutics
Mots-clésCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorEndocytosisChemistryEndocytic cycleScaffold proteinCell biologyTransmembrane proteinBand 3Molecular biologyCellSignal transductionMembrane proteinBiochemistryBiologyMembraneGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Membrane permeable bi‐arsenical dyes, such as fluorescein arsenical hairpin (FlAsH), bind tetracysteine‐tagged‐proteins emitting fluorescence in‐vivo . This fluorescence method (developed by R. Tsien) provides a tool to evaluate trafficking pathways in living cells. We generated a tetracysteine‐tagged Cystic Fibrosis Transmembrane Regulator (CFTR) protein and studied its expression with the long‐term goal of using this protein to study its trafficking during endocytosis. The tetracysteine‐tagged CFTR (CFTR‐TC) was predominantly expressed in both BHK and in Cos‐7 cells as the immature core‐glycosylated form (band B) rather than the mature glycosylated band C. Iodide efflux assays of CFTR‐TC's function as a chloride channel at the cell surface revealed an insignificant response after cAMP stimulation, likely reflecting its low band C expression. Interestingly, 1 hour FlAsH pre‐treatment evoked a mean response difference of −16.0 mV versus untreated (one‐way ANOVA p<0.05), suggesting increased band C expression. Our results suggest that FlAsH rescues the surface expression of CFTR‐TC and studies are ongoing to visualize its localization and the regulation of its trafficking by proteins involved in the endocytic pathway. The work is supported by the Natural Sciences and Engineering Research Council (postgraduate scholarship) and the Canadian Cystic Fibrosis Foundation BREATHE Program.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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