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Enregistrement W3016430988 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.04579

Loss of colonic epithelial NCOR1 aggravates experimental colitis chronicity

2020· article· en· W3016430988 sur OpenAlexaffabout
François Boudreau, Mia Lecours, Ariane Cristina Di Castro, Vilcy Reyes Nicolás, Christine M. Jones, Nathalie Perreault

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMacrophage Migration Inhibitory Factor
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInflammationBiologyCancer researchColitisRepressorDownregulation and upregulationGeneCell biologyGene expressionImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nuclear co‐repressor NCOR1 orchestrates the assembly of a large transcriptional repression complex that is involved in the negative regulation of pro‐inflammatory genes. Chronic intestinal inflammation is associated with sustained activation of pro‐inflammatory molecules. Since NCOR1 is considered as a potent repressor of pro‐inflammatory genes in macrophages, we aimed to investigate the role of intestinal epithelial NCOR1 during inflammatory stresses. Conditional deletion of Ncor1 in the whole intestinal epithelium was achieved by crossing Villin‐Cre and Ncor1 loxP/loxP C57BL/6 mouse models. DSS‐induced colitis in NCOR1 Δ IEC mice was more severe than control mice according to survival as well as clinical observations. A gene profiling analysis in the colon of non‐diseased NCOR1 Δ IEC and control mice identified 85 unique and mapped transcripts being significantly modulated between NCOR1 Δ IEC and control mice. An Ingenuity Pathway Analysis from these predicted target genes identified gastrointestinal disease (79 transcripts) as top disease and biofunction. Analysis of enriched targets in specific canonical pathways predicted an increase in the tryptophan degradation pathway ( P = 3.2E‐02), a pathway recently demonstrated to be strongly relevant to inflammatory bowel disease severity. Indoleamine‐pyrrole 2,3‐dioxygenase (IDO1), that catalyzes the first and rate‐limiting step of tryptophan oxidation, was induced more than 7 times in the colon of NCOR1 Δ IEC mice. IDO1 was also significantly more elevated in NCOR1 Δ IEC mice when compared to control mice both subjected to chronic inflammation (3 cycles of DSS). Spontaneous induction of Ido1 gene expression was also confirmed in cultured ex vivo colon organoids deleted for Ncor1 . In conclusion, our results highlight the critical role of NCOR1 to maintain intestinal inflammatory homeostasis during experimental colitis and uncover a novel function for NCOR1 in the regulation of Ido1 expression and potentially tryptophan metabolism. Support or Funding Information Canadian Institutes of Health Research

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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