Exploring the Structural Stability and Assembly Mechanism of Hydrophobin Proteins
Notice bibliographique
Résumé
Hydrophobins are small, globular proteins with amphiphilic character that are produced and secreted by filamentous fungi. At hydrophobic‐hydrophilic interfaces they self‐assemble into durable amyloid‐containing structures, called rodlets, which create protective, water repellent coatings for fungal spores. Current models of hydrophobin self‐assembly predict that hydrophobin monomers undergo a conformational change at a hydrophobic‐hydrophilic interface and integrate into a growing rodlet, however the mechanistic details of rodlet assembly are unknown. To investigate the assembly mechanism of hydrophobins, we carried out stability studies with SC16, a hydrophobin isolated from Schizophyllum commune. SC16 was recombinantly expressed using E. coli and purified by immobilized Ni 2+ affinity chromatography. NMR spectroscopy was used to determine that the structure of SC16 was minimally perturbed by denaturing (8 M urea) or reducing (2 mM DTT) conditions. Gel filtration chromatography indicated that in solution SC16 exists as a tetramer, suggesting that rodlet assembly does not initiate from hydrophobin monomers. Mutant forms of SC16 are being employed to determine the sequences and conformational changes required for rodlet assembly, with gel filtration chromatography used to determine the multimeric state, thioflavin T assays to quantify amyloid formation, and electron microscopy to visualize rodlet formation. X‐ray crystallography is being used to further characterize the tetrameric structure of SC16. Determining which hydrophobin sequences are responsible for self‐assembly will allow the rational modification of hydrophobins to add new functionalities or influence their self‐assembly. Support or Funding Information NSERC, Dalhousie University Faculty of Medicine, Nova Scotia Research Foundation, BioActives CREATE
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».