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Enregistrement W3016446471 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.04163

Exploring the Structural Stability and Assembly Mechanism of Hydrophobin Proteins

2020· article· en· W3016446471 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHydrophobinSize-exclusion chromatographySchizophyllum communeChemistryGlobular proteinThioflavinBiophysicsFungal proteinBiochemistryChromatographyBiologyMutantEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hydrophobins are small, globular proteins with amphiphilic character that are produced and secreted by filamentous fungi. At hydrophobic‐hydrophilic interfaces they self‐assemble into durable amyloid‐containing structures, called rodlets, which create protective, water repellent coatings for fungal spores. Current models of hydrophobin self‐assembly predict that hydrophobin monomers undergo a conformational change at a hydrophobic‐hydrophilic interface and integrate into a growing rodlet, however the mechanistic details of rodlet assembly are unknown. To investigate the assembly mechanism of hydrophobins, we carried out stability studies with SC16, a hydrophobin isolated from Schizophyllum commune. SC16 was recombinantly expressed using E. coli and purified by immobilized Ni 2+ affinity chromatography. NMR spectroscopy was used to determine that the structure of SC16 was minimally perturbed by denaturing (8 M urea) or reducing (2 mM DTT) conditions. Gel filtration chromatography indicated that in solution SC16 exists as a tetramer, suggesting that rodlet assembly does not initiate from hydrophobin monomers. Mutant forms of SC16 are being employed to determine the sequences and conformational changes required for rodlet assembly, with gel filtration chromatography used to determine the multimeric state, thioflavin T assays to quantify amyloid formation, and electron microscopy to visualize rodlet formation. X‐ray crystallography is being used to further characterize the tetrameric structure of SC16. Determining which hydrophobin sequences are responsible for self‐assembly will allow the rational modification of hydrophobins to add new functionalities or influence their self‐assembly. Support or Funding Information NSERC, Dalhousie University Faculty of Medicine, Nova Scotia Research Foundation, BioActives CREATE

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,167

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle