MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3016491209 · doi:10.1136/jclinpath-2020-206451

<i>SMARCA</i> family of genes

2020· review· en· W3016491209 sur OpenAlexaff
Runjan Chetty, Stefano Serra

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneComputational biologyBioinformaticsGeneticsBiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

lead to loss of expression of their respective proteins within the nucleus and, as such have characterised a set of malignancies that are underpinned by SMARCA-deficiency.The morphology of these tumours ranges from small to large epithelioid cells, giant cells and rhabdoid cells. The rhabdoid cells are frequently present in these tumours but are not a sine qua non for the diagnosis. Most of these tumours are undifferentiated or dedifferentiated, high-grade pleomorphic carcinomas. Focally, areas of better differentiation can be seen. The initial description of a SMARCA4-deficient malignancy was the small cell carcinoma of the ovary, hypercalcaemic type. Subsequently, tumours fitting this characteristic morphology and immunophenotype have been described in the lung, thoracic cavity, endometrium and sinonasal tract, gastrointestinal tract and kidney. Immunohistochemical loss of SMARCA2 and SMARCA4 may occur concomitantly or independently of each other.SMARCA-deficient malignant tumours represent a unique subset of tumours with typical morphological and immunohistochemical findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,706

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,133
Tête enseignante GPT0,460
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical PathologyMême sujetChromatin Remodeling and CancerTravaux en français237 207