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Enregistrement W3016532672 · doi:10.1038/s41436-020-0787-4

Resolving the dark matter of ABCA4 for 1054 Stargardt disease probands through integrated genomics and transcriptomics

2020· article· en· W3016532672 sur OpenAlexaff
Mubeen Khan, Stéphanie S. Cornelis, Laura Whelan, Esmee H. Runhart, Ketan Mishra, Femke Bults, Yahya AlSwaiti, Alaa AlTalbishi, Sandro Banfi, Eyal Banin, Miriam Bauwens, Tamar Ben‐Yosef, Camiel J. F. Boon, L. Ingeborgh van den Born, Sabine Defoort, Aurore Devos, Adrian Dockery, Ľubica Ďuďáková, Ana Fakin, G. Jane Farrar, Juliana Maria Ferraz Sallum, Kaoru Fujinami, Christian Gilissen, Damjan Glavač, Michael B. Gorin, Jacquie Greenberg, Takaaki Hayashi, Ymkje M. Hettinga, Alexander Hoischen, Carel B. Hoyng, Karsten Hufendiek, Herbert Jägle, Smaragda Kamakari, Marianthi Karali, Ulrich Kellner, Caroline C. W. Klaver, Bohdan Kousal, Tina M. Lamey, Ian M. MacDonald, Anna Matynia, Terri L. McLaren, Marcela Mena, Isabelle Meunier, Rianne Miller, Hadas Newman, Buhle Ntozini, Monika Ołdak, Marc Pieterse, Osvaldo L. Podhajcer, Bernard Puech, Raj Ramesar, Klaus Rüther, Manar Salameh, Mariana Vallim Salles, Dror Sharon, Francesca Simonelli, Georg Spital, Marloes Steehouwer, Jacek P. Szaflik, Jennifer A. Thompson, C. Thuillier, Anna M. Tracewska, Martine van Zweeden, Andrea L. Vincent, Xavier Zanlonghi, Petra Lišková, Heidi Stöhr, John N. De Roach, Carmen Ayuso, Lisa Roberts, Bernhard H. F. Weber, Claire‐Marie Dhaenens, Frans P.M. Cremers

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesEngineer Research and Development CenterBundesministerium für Bildung und ForschungEuropean Regional Development FundLandelijke Stichting voor Blinden en SlechtziendenInstituto de Salud Carlos IIIStichting BlindenhulpMedical Research CouncilFundación Conchita RábagoFoundation Fighting BlindnessVlaamse regeringStichting tot Verbetering van het Lot der BlindenFondazione RomaUniverzita Karlova v PrazeSouth African Medical Research CouncilUniversity of WashingtonMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaMedical Research Charities GroupBoehringer Ingelheim FondsStichting Steunfonds UitzichtFonds Wetenschappelijk OnderzoekStichting Blinden-PenningAlgemene Nederlandse Vereniging ter voorkoming van BlindheidUniversiteit GentMinistry of Health, State of Israel
Mots-clésABCA4Stargardt diseaseProbandGenomicsGeneticsDiseaseBiologyComputational biologyMedicineMutationGenomeInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations142
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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