Defining how viruses manipulate lipid phosphoinositides through activation of PI4P kinases to mediate viral replication
Notice bibliographique
Résumé
Phosphoinositide kinases are central regulators of myriad cellular processes, and their misregulation is causative of multiple human diseases. We are currently focusing on the structural basis for the regulation of phosphoinositide kinases, specifically the Golgi localised phosphatidylinositol 4‐kinase beta (PI4KB). We have identified a previously uncharacterised protein binding partner of PI4KB, the GTPase regulatory protein c10orf76 , and revealed novel insight into an unexpected PI4K positive feedback loop. Using a combined hydrogen deuterium exchange mass spectrometry (HDX‐MS) and structural biology approach we have defined the molecular basis of regulation by the protein c10orf76, revealing novel insight into the role of these PI4KB in viral replication. This has revealed key insight into unexpected feedback loops with Ras superfamily GTPases. Overall, this approach has provided a novel toolbox of engineered mutations to tease out the molecular basis of regulation of phosphoinositide kinases in both homeostasis and disease, and has revealed novel opportunities for the development of small molecule therapeutics for multiple pathogenic viral infections. Support or Funding Information Research was supported by the Canadian Institute of Health Research (CRN‐142393), and salary award for the CIHR new investigator and MSFHR scholar programs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».