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Enregistrement W3016572994 · doi:10.1080/17512433.2020.1758063

Can the microbiota predict response to systemic cancer therapy, surgical outcomes, and survival? The answer is in the gut

2020· review· en· W3016572994 sur OpenAlexaff
Khalid El Bairi, Rachid Jabi, Dario Trapani, H Boutallaka, Bouchra Ouled Amar Bencheikh, Mohammed Bouziane, M. Amrani, Saïd Afqir, Adil Maleb

Notice bibliographique

RevueExpert Review of Clinical Pharmacology · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineGut floraDysbiosisBacteroides fragilisContext (archaeology)CancerBiomarkerFusobacterium nucleatumClinical trialDiseaseImmune systemMicrobiomeColorectal cancerImmunologyOncologyBioinformaticsInternal medicineAntibioticsBiologyPeriodontitisMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Khalid El Bairiab* , Rachid Jabibc, Dario Trapanid , Hanae Boutallakae, Bouchra Ouled Amar Bencheikhf , Mohammed Bouzianebc, Mariam Amranig, Said Afqirabh & Adil Malebbi a Cancer Biomarkers Working Group, Mohamed Ist University, Oujda, Moroccob Faculty of Medicine and Pharmacy, Mohamed Ist University, Oujda, Moroccoc Department of Visceral Surgery, Mohamed VI University Hospital, Oujda, Moroccod Department of Haematology and Oncology, European Institute of Oncology, IEO, IRCCS, University of Milano, Milan, Italye Department of Gastroenterology and Digestive Endoscopy, Mohamed V Military Teaching Hospital of Rabat, Mohamed V University, Rabat, Moroccof Montreal Neurological Institute and Hospital, McGill University, Montreal, Canadag Department of Pathology, National Institute of Oncology, Faculty of Medicine and Pharmacy, Mohamed V University, Rabat, Moroccoh Department of Medical Oncology, Mohamed VI University Hospital, Oujda, Moroccoi Department of Microbiology, Mohamed VI University Hospital, Oujda, MoroccoCONTACT Khalid El Bairi k.elbairi@ump.ac.ma Faculty of Medicine and Pharmacy, Mohamed Ist University, Oujda, MoroccoABSTRACTIntroduction The gut microbiota seems to play a key role in tumorigenesis, across various hallmarks of cancer. Recent evidence suggests its potential use as a biomarker predicting drug response and adding prognostic information, generally in the context of immuno-oncology.Areas covered In this review, we focus on the modulating effects of gut microbiota dysbiosis on various anticancer molecules used in practice, including cytotoxic and immune-modulating agents, primarily immune-checkpoint inhibitors (ICI). Pubmed/Medline-based literature search was conducted to find potential original studies that discuss gut microbiota as a prognostic and predictive biomarker for cancer therapy. We also looked at the US ClinicalTrials.gov website to find additional studies particularly ongoing human clinical trials.Expert commentary Sequencing of stool-derived materials and tissue samples from cancer patients and animal models has shown a significant enrichment of various bacteria such as Fusobacterium nucleatum and Bacteroides fragilis were associated with resistant disease and poorer outcomes. Gut microbiota was also found to be associated with surgical outcomes and seems to play a significant role in anastomotic leak (ATL) after surgery mainly by collagen breakdown. However, this research field is just at the beginning and the current findings are not yet ready to change clinical practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,093
Tête enseignante GPT0,516
Écart entre enseignants0,423 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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