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Enregistrement W3016577620 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.06047

Changes in gene expression caused by genetic elimination of high molecular weight FGF2 are associated with prevention of stress‐induced cardiac systolic dysfunction

2020· article· en· W3016577620 sur OpenAlexaffabout
Elissavet Kardami, Navid Koleini, Barbara E. Nickel, Raghu S. Nagalingam, Natalie M. Landry, Robert R. Fandrich, David Cheung, Ian Dixon, Michael P. Czubryt, Davinder S. Jassal, Peter A. Cattini

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndocrinologyInternal medicineEndogenyPressure overloadFibroblast growth factorCardiac function curveMicroarray analysis techniquesHsp70Circadian rhythmGene expressionMedicineHeat shock proteinBiologyReceptorGeneMuscle hypertrophyHeart failureBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fibroblast growth factor 2 (FGF2) is produced as high (>20 kDa, Hi‐) and low molecular weight (18 kDa, Lo) isoforms in the heart. While administered Lo‐FGF2 has been established as a cardioprotective agent in multiple models of cardiac injury, there is limited information about the role of Hi‐FGF2 in the heart. To investigate the effect of endogenous Hi‐FGF2 we compared cardiac transcriptome (35240 targets, GeneChip™ Mouse Gene 2.0 ST Array (Affymetrix, 902119)) and systolic function between Hi‐FGF2 knock‐out mice, FGF2(Lo), expressing only Lo‐FGF2, and wild type mice, FGF2(WT), expressing both Hi‐FGF2 and Lo‐FGF2, under ‘normal’ (sham‐operated) and “stress” (pressure overload) conditions. Transaortic constriction surgery (TAC) was used to induce pressure overload. Echocardiography was done at baseline and at 4–8 weeks post‐surgery. Microarray analysis showed that under normal conditions, the absence of Hi‐FGF2 promoted changes in relative levels of 118 transcripts, including those associated with circadian rhythm regulation and heat shock protein (HSP70)‐associated apoptosis regulation. Comparative analysis of TAC surgery‐induced gene expression changes showed that 275 transcripts were differentially affected by the presence or absence of Hi‐FGF2 expression, most prominently the orphan nuclear receptor NR1D1 which is linked to regulation of circadian rhythm and metabolism. Under non‐stress conditions, systolic function was unaffected by endogenous Hi‐FGF2 expression. Pressure overload stress caused a decline in systolic function in the presence of endogenous Hi‐FGF2, at 4–8 weeks post‐TAC surgery, accompanied by increases in markers of myocardial stress/damage including B‐type natriuretic peptide (BNP) and the pro‐cell death protein BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein‐interacting protein‐3, Bnip3. In the absence of endogenous Hi‐FGF2, mice were protected from stress‐induced loss of systolic function and increases in BNP and Bnip3. TAC surgery induced Hi‐FGF2‐independent increases in: cardiac mass (heart weight/tibia length); cardiac fibrosis; transcripts linked to exracellular matrix remodeling. Increased cardiomyocyte size, however, was only observed in FGF2(WT) but not FGF2(Lo) hearts post‐TAC. It is suggested that elimination of endogenous Hi‐FGF2 elicits cardioprotection by increasing cardiac HSP70 (pre‐TAC surgery); and NR1D1, after TAC surgery. Support or Funding Information Funding (EK, PAC, DJ) was provided by the Canadian Institutes for Health Research (FRN‐74733) and the Molson Women’s Heart Health Foundation (EK). MPC was supported by a CIHR Open Operating Grant (MOP136862). NK and RSN were the recipients of a Bank of Montreal studentship award via the St. Boniface Hospital Albrechtsen Research Centre and University of Manitoba funding to PAC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,384

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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