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Enregistrement W3016631762 · doi:10.1016/j.jtho.2020.03.029

Canadian Multicenter Project on Standardization of Programmed Death-Ligand 1 Immunohistochemistry 22C3 Laboratory-Developed Tests for Pembrolizumab Therapy in NSCLC

2020· article· en· W3016631762 sur OpenAlexafffundabout
Emina Torlakovic, Roula Albadine, Gilbert Bigras, Alexander H. Boag, Anna Bojarski, Michael Cabanero, Sophie Camilleri‐Broët, Carol C. Cheung, Christian Couture, Kenneth J. Craddock, Jean‐Claude Cutz, Prashant Dhamanaskar, Pierre Fiset, Mohammad Hossain, David Hwang, Diana N. Ionescu, Doha Itani, Margaret M. Kelly, Keith Kwan, Hyun J. Lim, Søren Nielsen, Gefei Qing, Harman Sekhon, Alan Spatz, Ranjit Waghray, Hangjun Wang, Zhaolin Xu, Ming‐Sound Tsao

Notice bibliographique

RevueJournal of Thoracic Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthorityJewish General HospitalDalhousie UniversityUniversity of OttawaOttawa HospitalUniversity of ManitobaMcGill UniversityLondon Health Sciences CentreSaint John Regional HospitalUniversity of British ColumbiaSunnybrook Health Science CentreMcMaster UniversityManitoba HealthCredit Valley HospitalSouthlake Regional Health CenterTrillium Health CentreSt. Joseph’s Healthcare HamiltonInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecMcGill University Health CentreRoyal University HospitalUniversity of TorontoUniversity of CalgaryHealth Sciences CentreUniversity of AlbertaUniversity Health NetworkHealth Sciences NorthQueen's UniversityKingston General HospitalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalSaskatchewan Health AuthorityUniversité LavalUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesEMD SeronoPfizer CanadaMerckMerck CanadaAstraZeneca CanadaAstraZenecaPfizerBristol-Myers Squibb
Mots-clésPembrolizumabMedicineStandardizationImmunohistochemistryOncologyInternal medicineImmunotherapyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The programmed death-ligand 1 (PD-L1) immunohistochemistry (IHC) assay is used to select patients for first or second-line pembrolizumab monotherapy in NSCLC. The PD-L1 IHC 22C3 pharmDx assay requires an Autostainer Link 48 instrument. Laboratories without this stainer have the option to develop a highly accurate 22C3 IHC laboratory-developed test (LDT) on other instruments. The Canadian 22C3 IHC LDT validation project was initiated to harmonize the quality of PD-L1 22C3 IHC LDT protocols across 20 Canadian pathology laboratories. METHODS: Centrally optimized 22C3 LDT protocols were distributed to participating laboratories. The LDT results were assessed against results using reference PD-L1 IHC 22C3 pharmDx. Analytical sensitivity and specificity were assessed using cell lines with varying PD-L1 expression levels (phase 1) and IHC critical assay performance controls (phase 2B). Diagnostic sensitivity and specificity were assessed using whole sections of 50 NSCLC cases (phase 2A) and tissue microarrays with an additional 50 NSCLC cases (phase 2C). RESULTS: In phase 1, 80% of participants reached acceptance criteria for analytical performance in the first attempt with disseminated protocols. However, in phase 2A, only 40% of participants reached the desired diagnostic accuracy for both 1% and 50% tumor proportion score cutoff. In phase 2B, further protocol modifications were conducted, which increased the number of successful laboratories to 75% in phase 2C. CONCLUSIONS: It is possible to harmonize highly accurate 22C3 LDTs for both 1% and 50% tumor proportion score in NSCLC across many laboratories with different platforms. However, despite a centralized approach, diagnostic validation of predictive IHC LDTs can be challenging and not always successful.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,065
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,842
Score d'incertitude au seuil0,341

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0650,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0040,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,423
Écart entre enseignants0,379 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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