Small Changes of Active Site Residues of an Acinetobacter Aminoglycoside Acetyltransferase Affect Antibiotic Susceptibility
Notice bibliographique
Résumé
Antibiotics are drugs used to treat bacterial infections by inhibiting growth and proliferation of microorganisms. Commonly prescribed broad‐spectrum antibiotics include aminoglycosides, but many bacteria have developed resistance to these drugs by acquiring enzymes that acetylate them. We previously reported the structural and kinetic characterization of two of these enzymes from Acinetobacter. However, several outstanding questions regarding the role of specific residues in the active site of these proteins remain. In particular, we observed an active site residue that was different between these two enzymes and appeared to alter the aminoglycoside binding pocket. It has been previously shown that active site mutations within aminoglycoside acetyltransferase enzymes can adjust their ability to modify aminoglycosides and therefore their susceptibility. Since we cannot predict which point mutations will ultimately enhance their activity and therefore resistance to aminoglycosides, we performed saturation mutagenesis of this residue in the Acinetobacter haemolyticus AAC(6′)‐Ig enzyme and tested the antibiotic susceptibility of Escherichia coli to four different aminoglycosides when these mutants were overexpressed. We found the identity of the amino acid at this position was critical for altering the susceptibility of E. coli to these antibiotics. Additionally, these mutants exhibited different susceptibility patterns depending upon the identity of aminoglycoside tested. Our results show how small changes of active site residues of aminoglycoside acetyltransferase can drastically affect bacterial susceptibility to aminoglycosides, and may provide insight to which antibiotics could be effective for treating Acinetobacter infections. Support or Funding Information Research reported in this work was supported by the National Institute of General Medical Sciences of the National Institutes of Health under Award Number R35GM133506 (to MLK).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».