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Enregistrement W3016698954 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.04965

Biophysical characterization of a series of novel non‐RAFT copolymers with improved buffer behavior

2020· article· en· W3016698954 sur OpenAlexaff
Mansoore Esmaili, Michael Overduin

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDispersityRaftPolymerAmphiphileChemistryMembraneCopolymerBilayerLipid bilayerNanodiscMaleic acidPolymer chemistryBiophysicsChemical engineeringOrganic chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synthetic amphipathic polymers present an invaluable tool for excision and liberation of superstructures of membrane proteins (MPs) and their surrounding annular membrane bilayer in donut‐shaped nanoparticles or discs. Styrene‐ co ‐maleic acid polymers (SMAs) have demonstrated most efficiency for the structural characterization of membrane proteins. However, some drawbacks such as sensitivity to acidic pH and high concentration of divalent cations, interference with the spectroscopic profiles of proteins, high polydispersity index (PDI) and nonspecific interaction with protein surface have hindered the ultimate optimal utilization of SMA polymers for functional characterization of MPs in lipid bilayer and hence for drug discovery purposes. We have developed multiple series of novel non‐RAFT amphipathic polymers that demonstrate improved behaviors in acidic pH and high concentration of calcium. Some of these unique amphipathic polymers display exemplary polydispersity (PDI ~1), strict alternation (a well‐defined sequence of comonomers) and distinct spectrophotometric profiles. We further characterized the application of these novel polymeric detergents for purification of a model integral beta‐barrel MP, PagP, from the outer membrane of E. coli .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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