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Enregistrement W3016875041 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.04306

Deletion of Mouse <i>Sf3b4</i> in Neural Crest Cells Causes Craniofacial Abnormalities

2020· article· en· W3016875041 sur OpenAlexaffabout
Shruti Kumar, Sabrina Alam, Marie‐Claude Beauchamp, Jacek Majewski, Loydie A. Jerome‐Majewska

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNeural crestHaploinsufficiencyCraniofacialGeneticsNeural tubeIn situ hybridizationAnatomyEmbryoGenePhenotypeGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The SF3B4 gene encodes a core component of the U2‐major spliceosome complex important during splicing of pre‐mRNA to mRNA. Recently, patients with two craniofacial disorders: Nager syndrome and Rodriguez syndrome were identified to carry rare mutations in this gene. The autosomal dominant nature of these syndromes indicates that this is due to haploinsufficiency for SF3B4 . Both disorders affect the face as well as the limb including both hands and feet. Nager syndrome patients survive and exhibit smaller jaw bones, smaller cheek bones, cleft palate, hearing problems as well as downward slanted eyelids. However, Rodriguez syndrome is much more severe, and patients often die before or soon after birth. We hypothesized that craniofacial abnormalities associated with reduced SF3B4 levels is due to tissue‐specific expression and requirement of this gene in neural crest cells. Using in situ hybridization, we showed that in mouse embryos, Sf3b4 was expressed ubiquitously from embryonic day (E)9.5 – E12.5. From E10.5 – E12.5, enriched expression of this gene was found in the maxillomandibular region, limb and tail bud. To generate a conditional mutant mouse line for Sf3b4 , we used CRISPR/Cas9 to insert LoxP sequences in intron 1 and 3 of this gene. To test our hypothesis, we mated Sf3b4 conditional mutant mice to Wnt1‐Cre2 transgenic mice to delete exons 2 and 3 specifically in neural crest cells. Heterozygous mutant embryos from these matings were normal. From E9.0 onwards, all homozygous mutant embryos had hypoplasia of the midbrain and pharyngeal arches. Homozygous mutant embryos died by E14.5. To examine neural crest cells and their derivatives in the head and craniofacial region, we used the Rosa26R lacZ reporter line. LacZ staining of mutant embryos showed a reduced number of neural crest cells in pharyngeal arches. Thus, our data suggests that craniofacial malformations due to mutations in SF3B4 are the result of reduced neural crest cells. Support or Funding Information Canadian Institutes of Health Research (CIHR)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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