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Enregistrement W3016887434 · doi:10.1101/lm.051177.119

Learning-induced mRNA alterations in olfactory bulb mitral cells in neonatal rats

2020· article· en· W3016887434 sur OpenAlexafffund
Michaelina Naadu Nartey, Lourdes Peña‐Castillo, Megan LeGrow, Jules J.E. Doré, Sriya Bhattacharya, Andrea Darby‐King, Samantha J. Carew, Qi Yuan, Carolyn W. Harley, John H. McLean

Notice bibliographique

RevueLearning & Memory · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyOlfactory bulbOdorNeuroscienceMessenger RNACell biologyCREBTranscription factorPsychologyGeneticsGeneCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the olfactory bulb, a cAMP/PKA/CREB-dependent form of learning occurs in the first week of life that provides a unique mammalian model for defining the epigenetic role of this evolutionarily ancient plasticity cascade. Odor preference learning in the week-old rat pup is rapidly induced by a 10-min pairing of odor and stroking. Memory is demonstrable at 24 h, but not 48 h, posttraining. Using this paradigm, pups that showed peppermint preference 30 min posttraining were sacrificed 20 min later for laser microdissection of odor-encoding mitral cells. Controls were given odor only. Microarray analysis revealed that 13 nonprotein-coding mRNAs linked to mRNA translation and splicing and 11 protein-coding mRNAs linked to transcription differed with odor preference training. MicroRNA23b, a translation inhibitor of multiple plasticity-related mRNAs, was down-regulated. Protein-coding transcription was up-regulated for Sec23b, Clic2, Rpp14, Dcbld1, Magee2, Mstn, Fam229b, RGD1566265, and Mgst2. Gng12 and Srcg1 mRNAs were down-regulated. Increases in Sec23b, Clic2, and Dcbld1 proteins were confirmed in mitral cells in situ at the same time point following training. The protein-coding changes are consistent with extracellular matrix remodeling and ryanodine receptor involvement in odor preference learning. A role for CREB and AP1 as triggers of memory-related mRNA regulation is supported. The small number of gene changes identified in the mitral cell input/output link for 24 h memory will facilitate investigation of the nature, and reversibility, of changes supporting temporally restricted long-term memory.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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