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Enregistrement W3016910668 · doi:10.1038/s41598-020-63817-8

Application of in vivo solid phase microextraction (SPME) in capturing metabolome of apple (Malus ×domestica Borkh.) fruit

2020· article· en· W3016910668 sur OpenAlexafffund
Sanja Risticevic, Érica A. Souza-Silva, Emanuela Gionfriddo, Jennifer R. DeEll, Jack Cochran, W. Scott Hopkins, Janusz Pawliszyn

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueChemical synthesis and alkaloids
Établissements canadiensMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Waterloo
Mots-clésMetabolomeSolid-phase microextractionMetabolomicsHexanalMetaboliteMalusChemistryNonanalPhenylpropanoidIn vivoMetabolic pathwayBiologyChromatographyBiochemistryGas chromatography–mass spectrometryBotanyMass spectrometryMetabolismEnzymeBiotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An in vivo direct-immersion SPME sampling coupled to comprehensive two-dimensional gas chromatography - time-of-flight mass spectrometry (GCxGC-ToFMS) was employed to capture real-time changes in the metabolome of 'Honeycrisp' apples during ripening on the tree. This novel sampling approach was successful in acquiring a broad metabolic fingerprint, capturing unique metabolites and detecting changes in metabolic profiles associated with fruit maturation. Several metabolites and chemical classes, including volatile esters, phenylpropanoid metabolites, 1-octen-3-ol, hexanal, and (2E,4E)-2,4-hexadienal were found to be up-regulated in response to fruit maturation. For the first time, Amaryllidaceae alkaloids, metabolites with important biological activities, including anti-cancer, anti-viral, anti-parasitic, and acetylcholinesterase (AChE) inhibitory activity, were detected in apples. Considering the elimination of oxidative degradation mechanisms that adversely impact the representativeness of metabolome obtained ex vivo, and further evidence that lipoxygenase (LOX) pathway contributes to volatile production in intact fruit, in vivo DI-SPME represents an attractive approach for global plant metabolite studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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