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Enregistrement W3017176402 · doi:10.1093/sleep/zsaa077

Beyond K-complex binary scoring during sleep: probabilistic classification using deep learning

2020· article· en· W3017176402 sur OpenAlexaboutno aff
Bastien Lechat, Kristy L. Hansen, Peter Catcheside, Branko Zajamšek

Notice bibliographique

RevueSLEEP · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueSleep and Wakefulness Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute of General Medical SciencesNational Health and Medical Research CouncilAustralian Research Council
Mots-clésProbabilistic logicArtificial intelligenceBinary classificationSleep (system call)Sleep StagesBinary numberComputer sciencePattern recognition (psychology)Feature (linguistics)ElectroencephalographyProbabilistic classificationAudiologyMachine learningPsychologyPolysomnographyMedicineMathematicsSupport vector machinePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

STUDY OBJECTIVES: K-complexes (KCs) are a recognized electroencephalography marker of sensory processing and a defining feature of sleep stage 2. KC frequency and morphology may also be reflective of sleep quality, aging, and a range of sleep and sensory processing deficits. However, manual scoring of K-complexes is impractical, time-consuming, and thus costly and currently not well-standardized. Although automated KC detection methods have been developed, performance and uptake remain limited. METHODS: The proposed algorithm is based on a deep neural network and Gaussian process, which gives the input waveform a probability of being a KC ranging from 0% to 100%. The algorithm was trained on half a million synthetic KCs derived from manually scored sleep stage 2 KCs from the Montreal Archive of Sleep Study containing 19 healthy young participants. Algorithm performance was subsequently assessed on 700 independent recordings from the Cleveland Family Study using sleep stages 2 and 3 data. RESULTS: The developed algorithm showed an F1 score (a measure of binary classification accuracy) of 0.78 and thus outperforms currently available KC scoring algorithms with F1 = 0.2-0.6. The probabilistic approach also captured expected variability in KC shape and amplitude within individuals and across age groups. CONCLUSIONS: An automated probabilistic KC classification is well suited and effective for systematic KC detection for a more in-depth exploration of potential relationships between KCs during sleep and clinical outcomes such as health impacts and daytime symptomatology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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