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Enregistrement W3017199380 · doi:10.1111/all.14322

TCRs with segment TRAV9‐2 or a CDR3 histidine are overrepresented among nickel‐specific CD4+ T cells

2020· article· en· W3017199380 sur OpenAlexaff
Marina Aparicio‐Soto, Franziska Riedel, Melanie Leddermann, Petra Bächer, Alexander Scheffold, Heiner Kuhl, Bernd Timmermann, Dmitriy M. Chudakov, Sonja Molin, Margitta Worm, Guido Heine, Hermann‐Josef Thierse, Andreas Luch, Katherina Siewert

Notice bibliographique

RevueAllergy · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueContact Dermatitis and Allergies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesBundesinstitut für RisikobewertungMinistry of Science and Higher Education of the Russian Federation
Mots-clésNickelHistidineChemistryImmunologyBiologyBiochemistryEnzymeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Nickel is the most frequent cause of T cell–mediated allergic contact dermatitis worldwide. In vitro, CD4+ T cells from all donors respond to nickel but the involved αβ T cell receptor (TCR) repertoire has not been comprehensively analyzed. Methods We introduce CD154 (CD40L) upregulation as a fast, unbiased, and quantitative method to detect nickel‐specific CD4+ T cells ex vivo in blood of clinically characterized allergic and non allergic donors. Naïve (CCR7+ CD45RA+) and memory (not naïve) CD154+ CD4+ T cells were analyzed by flow cytometry after 5 hours of stimulation with 200 µmol/L NiSO 4 ., TCR α‐ and β‐chains of sorted nickel‐specific and control cells were studied by high‐throughput sequencing. Results Stimulation of PBMCs with NiSO 4 induced CD154 expression on ~0.1% (mean) of naïve and memory CD4+ T cells. In allergic donors with recent positive patch test, memory frequencies further increased ~13‐fold and were associated with markers of in vivo activation. CD154 expression was TCR‐mediated since single clones could be specifically restimulated. Among nickel‐specific CD4+ T cells of allergic and non allergic donors, TCRs expressing the α‐chain segment TRAV9‐2 or a histidine in their α‐ or β‐chain complementarity determining region 3 (CDR3) were highly overrepresented. Conclusions Induced CD154 expression represents a reliable method to study nickel‐specific CD4+ T cells. TCRs with particular features respond in all donors, while strongly increased blood frequencies indicate nickel allergy for some donors. Our approach may be extended to other contact allergens for the further development of diagnostic and predictive in vitro tests.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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