Sensitive and Comprehensive Lipid Mediator Analysis using Advanced Scheduled MRM with Polarity Switching and QTRAP Enhanced Product Ion Scanning
Notice bibliographique
Résumé
Using a QTRAP® 6500+ system coupled with an ExionLC™ System, we developed a targeted panel of 88 compounds for comprehensive profiling of lipid mediators and pathway markers. A Kinetex® Polar C18 column was used for LC based separation of lipid mediators, epimers and other isoelemental structures within a 20 min run time. Advanced scheduled sMRM was used to optimize scanning windows and dwell weighting. The negative mode lipid mediator panel includes pro‐inflammatory prostaglandins, leukotrienes and their primary metabolites, specialized pro‐resolving mediators (SPM) including resolvins, protectins, maresins, and lipoxins, biomarkers of ROS and NOS, and fatty acid and mono‐hydroxy fatty acid precursors. The positive mode panel includes cysteinyl leukotrienes, PAF, and maresin and protectin conjugates in tissue regeneration (MCTRs and PCTRs). Concentration curves were generated by injecting 3 replicate injections of 8 different concentrations of each lipid mediator standard. Excellent linearity is observed with r 2 of at least 0.997 for all analytes. Excellent sensitivity was obtained for all lipid mediator species with LLOQ between 0.05 and 1 ng/mL and CV < 30%. The unique qualitative/quantitative QTRAP platform also enabled MRM triggered EPI experiments which provided high sensitivity MS/MS data for confirmation of low level analytes. Baseline separation of LXA 4 and 15‐epi‐LXA 4 well as RvD1 and 17‐epi‐RvD1 enables the differentiation of enzymatic pathway utilization for pro‐resolving lipid mediator production.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».