An MRI-Derived Neuroanatomical Atlas of the Fischer 344 Rat Brain
Notice bibliographique
Résumé
This paper reports the development of a high-resolution 3-D MRI atlas of the Fischer 344 adult rat brain. The atlas is a 60 μm isotropic image volume composed of 256 coronal slices with 71 manually delineated structures and substructures. The atlas was developed using Pydpiper image registration pipeline to create an average brain image of 41 four-month-old male and female Fischer 344 rats. Slices in the average brain image were then manually segmented, individually and bilaterally, on the basis of image contrast in conjunction with Paxinos and Watson's (2007) stereotaxic rat brain atlas. Summary statistics (mean and standard deviation of regional volumes) are reported for each brain region across the sample used to generate the atlas, and a statistical comparison of a chosen subset of regional brain volumes between male and female rats is presented. On average, the coefficient of variation of regional brain volumes across all rats in our sample was 4%, with no individual brain region having a coefficient of variation greater than 13%. A full description of methods used, as well as the atlas, the template that the atlas was derived from, and a masking file, can be found on Zenodo at www.zenodo.org/record/3700210. To our knowledge, this is the first MRI atlas created using Fischer 344 rats and will thus provide an appropriate neuroanatomical model for researchers working with this strain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».