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Enregistrement W3018013674 · doi:10.3389/fncom.2020.00034

Topological View of Flows Inside the BOLD Spontaneous Activity of the Human Brain

2020· article· en· W3018013674 sur OpenAlexafffund
Arjuna P. H. Don, James F. Peters, Sheela Ramanna, Arturo Tozzi

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Computational Neuroscience · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueTopological and Geometric Data Analysis
Établissements canadiensUniversity of WinnipegUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaIstituto Nazionale di Alta Matematica "Francesco Severi"
Mots-clésTopology (electrical circuits)Functional magnetic resonance imagingResting state fMRIBlood-oxygen-level dependentComputer sciencePersistent homologyBrain activity and meditationTopological data analysisBetti numberArtificial intelligenceComputer visionMathematicsPsychologyAlgorithmElectroencephalographyNeurosciencePure mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spatio-temporal brain activities with variable delay detectable in resting-state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) give rise to highly reproducible structures, termed cortical lag threads, that propagate from one brain region to another. Using a computational topology of data approach, we found that persistent, recurring blood oxygen level dependent (BOLD) signals in triangulated rs-fMRI videoframes display previously undetected topological findings, i.e., vortex structures that cover brain activated regions. Measure of persistence of vortex shapes in BOLD signal propagation is carried out in terms of Betti numbers that rise and fall over time during spontaneous activity of the brain. Importantly, a topology of data given in terms of geometric shapes of BOLD signal propagation offers a practical approach in coping with and sidestepping massive noise in neurodata, such as unwanted dark (low intensity) regions in the neighborhood of non-zero BOLD signals. Our findings have been codified and visualized in plots able to track the non-trivial BOLD signals that appear intermittently in a sequence of rs-fMRI videoframes. The end result of this tracking of changing lag structures is a so-called persistent barcode, which is a pictograph that offers a convenient visual means of exhibiting, comparing, and classifying brain activation patterns.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0040,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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