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Enregistrement W3018597893 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.09571

Investigating the Effects of Histone H3.3 Point Mutations in Neural Crest Cells and Craniofacial Development

2020· article· en· W3018597893 sur OpenAlexaff
Nadine Nzirorera, Nada Jabado, Loydie Majewska

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNeural crestHistoneHistone H3Histone methylationHistone codeChromatinCell biologyEpigeneticsGeneticsNucleosomeDNA methylationGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Craniofacial development is an intricate process that requires the meticulous and coordinated expression of many genes. Histone proteins which are fundamental to both the structural integrity and organization of DNA into nucleosomes and consequently, chromatin play an important role in coordinated gene expression. Furthermore, the modification of histone tails is now known to be an essential mechanism for coordinated expression of a large number of genes. Recently, a point mutation in the gene h3f3a which encodes the histone variant Histone H3.3, was identified in a forward genetic screen in zebrafish. H3.3A was found to be important for neural crest cell induction and generation of cranial neural crest cell derived head bones. The authors proposed that incorporation of histone H3.3 was required for expression of genes important for cranial neural crest cell specification, whereas remodelling of this histone tail may be important for later stages in neural crest cell differentiation. However, it remains to be confirmed if disrupted modification of histone tails is also important in neural crest cells. We postulate that modification of the H3.3 tail is required for coordinated expression of genes important for neural crest migration and/or differentiation. To test this hypothesis, we used CRISPR/Cas9 to generate a mouse line with a conditional missense mutation in H3f3a. The mutation generated was previously shown to result in an abnormal increase in methylation of K27 and a decrease in methylation of K36 of the histone H3.3 tail. In this poster, we will present preliminary data using the Wnt‐1 Cre2 mouse line to drive expression of this dominant negative mutation in neural crest cells. Alcian Blue Staining will be used to analyze cartilage in E14.5 embryos and alizarin red will be used to stain bones formed in heads of E17.5 embryos. Bones will be analyzed in control and mutant embryos. Our result will enable us to uncover if K27 or K36 methylation is important in neural crest cell formation, migration and/or differentiation. This work will begin to unravel the role of epigenetics in neural crest cell formation. Support or Funding Information

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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