Mapping the Multi‐Modal Distribution of Craniofacial Phenotypes in NOSIP Mutants
Notice bibliographique
Résumé
Nitric Oxide Synthase Interacting Protein (NOSIP) is a E3 mono‐ubiquitin ligase that regulates the activity of protein phosphatase 2A. Deletion of NOSIP leads to severe and variable malformations of the craniofacial complex. Our goal was to use NOSIP mutant mice to understand of mechanisms of phenotypic variation. The phenotype of an individual embryo is the product of the developmental trajectory that it previously traversed. We propose that this concept of canalization is essential for understanding the etiology of complex phenotypic outcomes. We have previously shown that the brain patterns the face, so sequential perturbations affecting the brain and face may create unique developmental trajectories that each embryo transits. We tested this by creating a 3D morphospace of NOSIP heterozygous and homozygous mutants to determine if embryos occupy unique morphospace regions based on affected craniofacial structures. Embryos between embryonic day 10.5 (E10.5) to E17.5 were collected, fixed, and imaged (mCT). Anatomical features were reconstructed using Avizo. NOISP expression appears to be restricted to the neuroepithelium, lower jaw mesenchyme, and mesenchyme and epithelium in tissue adjacent to the frontonasal ectodermal zone between stage E10.5‐11.5. Embryos with a single telencephalic lobe had more severe facial malformations, including micrognathia and obstructed airway without significant changes in early cell apoptosis (via TUNEL staining). Embryos with normal telencephalic vesicle separation had less severe facial phenotypes, including left‐right mild asymmetry and clefting. Overall, it appears that NOSIP‐KO creates a multi‐modal distribution of craniofacial phenotypes along the developmental timeline by affecting early brain development, suggesting that understanding canalization may provide insight into the complexity of genotype‐phenotype map (Fig. ). Support or Funding Information Funding was provided by NIH F32DE08476 and R01DE019638 grants. Schematic of the changing phenotypic landscape describing the multi‐modal distribution of craniofacial phenotypes within NOSIP +/− and NOSIP −/− embryos compared to wildtype (light blue). Figure 1
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».