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Enregistrement W3019150010 · doi:10.1007/s11306-020-01683-1

Differential correlation network analysis identified novel metabolomics signatures for non-responders to total joint replacement in primary osteoarthritis patients

2020· article· en· W3019150010 sur OpenAlexafffund
Christie A. Costello, Ting Hu, Ming Liu, Weidong Zhang, Andrew Furey, Zhaozhi Fan, Proton Rahman, Edward Randell, Guangju Zhai

Notice bibliographique

RevueMetabolomics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine, Memorial University of NewfoundlandCanadian Institutes of Health ResearchMemorial University of NewfoundlandResearch and Development Corporation of Newfoundland and Labrador
Mots-clésMetabolomicsOsteoarthritisMedicineCorrelationJoint arthroplastyInflammationBioinformaticsInternal medicineBiologyArthroplastyPathologySurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Up to one third of total joint replacement patients (TJR) experience poor surgical outcome. OBJECTIVES: To identify metabolomic signatures for non-responders to TJR in primary osteoarthritis (OA) patients. METHODS: A newly developed differential correlation network analysis method was applied to our previously published metabolomic dataset to identify metabolomic network signatures for non-responders to TJR. RESULTS: Differential correlation networks involving 12 metabolites and 23 metabolites were identified for pain non-responders and function non-responders, respectively. CONCLUSION: The differential networks suggest that inflammation, muscle breakdown, wound healing, and metabolic syndrome may all play roles in TJR response, warranting further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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