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Enregistrement W3019248489 · doi:10.1101/2020.04.20.051805

ILC1-derived TGFβ1 drives intestinal remodelling

2020· preprint· en· W3019248489 sur OpenAlexaff
Geraldine M. Jowett, Michael D. A. Norman, Tracy T. L. Yu, Patricia Rosell Arévalo, Dominique Hoogland, Suzette T. Lust, Emily Read, Eva Hamrud, Nick Walters, Umar Niazi, Matthew Wai Heng Chung, Daniele Marciano, Omer S. Omer, Tomasz Zabinski, Davide Danovi, Graham M. Lord, Jöns Hilborn, Nicholas D. Evans, Cécile A. Dreiss, Laurent Bozec, Oommen P. Oommen, Christian D. Lorenz, Ricardo M. P. da Silva, Joana F. Neves, Eileen Gentleman

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueIL-33, ST2, and ILC Pathways
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilWellcome TrustLondon Centre for NanotechnologyResearch Councils UKUK Research and InnovationEngineering and Physical Sciences Research CouncilLeverhulme TrustNational Institute for Health and Care ResearchKing's College LondonKing's College Hospital NHS Foundation TrustBritish Heart Foundation
Mots-clésCell biologyExtracellular matrixOrganoidMMP9SecretionBiologyChemistryDownregulation and upregulationGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Organoids can shed light on the dynamic interplay between complex tissues and rare cell types within a controlled microenvironment. Here, we developed gut organoid co-cultures with type-1 innate lymphoid cells (ILC1) to dissect the impact of their accumulation in inflamed intestines. We demonstrate for the first time that murine and human ILC1 secrete TGFβ1, driving expansion of CD44v6 + epithelial crypts. ILC1 additionally express MMP9 and drive gene signatures indicative of extracellular matrix remodelling. We therefore encapsulated human epithelial-mesenchymal intestinal organoids in MMP-sensitive, synthetic hydrogels designed to form efficient networks at low polymer concentrations. Harnessing this defined system, we demonstrate that ILC1 drive matrix softening and stiffening, which we suggest occurs through balanced matrix degradation and deposition. Our platform enabled us to elucidate previously undescribed interactions between ILC1 and their microenvironment, which suggest that they may exacerbate fibrosis and tumour growth when enriched in inflamed patient tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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