TGF-β and IL-15 Synergize through MAPK Pathways to Drive the Conversion of Human NK Cells to an Innate Lymphoid Cell 1–like Phenotype
Notice bibliographique
Résumé
Circulating NK cells are known to convert to a type 1 innate lymphoid cell (ILC1)-like phenotype in response to TGF-β exposure. However, the precise cellular changes defining this process as well as the downstream signaling pathways guiding it remain poorly defined, particularly in humans. We used mass cytometry by time-of-flight (CyTOF) to model this phenotypic shift in vitro and identify a synergistic activity of TGF-β and IL-15 in this cellular conversion. CyTOF profiling identified substantial heterogeneity in the propensity of NK cells to adopt an ILC1-like phenotype in culture, characterized by the step-wise acquisition of various markers, including CD69, CD9, CD103, and CD49a. Activating and inhibitory receptors, including NKG2A, NKG2D, KIR2DL1, KIR3DL1, NKp30, NKp44, and NKp46, were all found to be upregulated exclusively on the cellular subsets that converted most readily in response to TGF-β. An assessment of downstream TGF-β signaling identified TAK1-mediated activation of p38 MAPK as the critical pathway driving conversion. IL-15 enhanced TGF-β-mediated conversion through Ras:RAC1 signaling as well as via the activation of MEK/ERK. Interestingly, the adoption of an ILC1-like phenotype was independent of the effect of IL-15 or TGF-β on mTOR, as the culture of NK cells in the presence of mTOR inhibitors, such as rapamycin or torin1, had minimal impact on the degree of conversion. In conclusion, we have used in vitro human culture systems and CyTOF to define the conversion of circulating NK cells to an ILC1-like phenotype and have clarified the pathways responsible for this process.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».