MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3019429981 · doi:10.1371/journal.pone.0231902

Phylogenetic relationships of Pseudo-nitzschia subpacifica (Bacillariophyceae) from the Mexican Pacific, and its production of domoic acid in culture

2020· article· en· W3019429981 sur OpenAlexfundno aff
Sonia Quijano‐Scheggia, Aramis Olivos‐Ortiz, Ernesto García‐Mendoza, Yaireb Sánchez-Bravo, Ramón Sosa-Ávalos, Nathalli Salas Marias, Hong Chang Lim

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine Toxins and Detection Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans Canada
Mots-clésDomoic acidBayBiologyAlgal bloomPacific oceanPhylogenetic treeAlgaeBotanyToxinPhytoplanktonEcologyOceanographyNutrientBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudo-nitzschia is a cosmopolitan genus, some species of which can produce domoic acid (DA), a neurotoxin responsible for the Amnesic Shellfish Poisoning (ASP). In this study, we identified P. subpacifica for the first time in Todos Santos Bay and Manzanillo Bay, in the Mexican Pacific using SEM and molecular methods. Isolates from Todos Santos Bay were cultivated under conditions of phosphate sufficiency and deficiency at 16°C and 22°C to evaluate the production of DA. This toxin was detected in the particulate (DAp) and dissolved (DAd) fractions of the cultures during the exponential and stationary phases of growth of the cultures. The highest DA concentration was detected during the exponential phase grown in cells maintained in P-deficient medium at 16°C (1.14 ± 0.08 ng mL-1 DAd and 4.71 ± 1.11 × 10-5 ng cell-1 of DAp). In P-sufficient cultures DA was higher in cells maintained at 16°C (0.25 ± 0.05 ng mL-1 DAd and 9.41 ± 1.23 × 10-7 ng cell-1 of DAp) than in cells cultured at 22°C. Therefore, we confirm that P. subpacifica can produce DA, especially under P-limited conditions that could be associated with extraordinary oceanographic events such as the 2013-2016 "Blob" in the northeastern Pacific Ocean. This event altered local oceanographic conditions and possibly generated the presence of potential harmful species in areas with economic importance on the Mexican Pacific coast.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,296
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetMarine Toxins and Detection MethodsTravaux en français237 207