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Enregistrement W3019585173 · doi:10.1002/ijgo.13185

Prevalent and persistent oncogenic HPV types in a cohort of women living with HIV prior to HPV vaccination

2020· article· en· W3019585173 sur OpenAlexafffundabout
Elisabeth McClymont, Marette Lee, Janet Raboud, François Coutlée, Sharon Walmsley, Nancy Lipsky, Mona Loutfy, Sylvie Trottier, Fiona Smaill, Marina B. Klein, Marianne Harris, Jeffrey Cohen, Mark H. Yudin, Wendy Wobeser, Deborah Money

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Gynecology & Obstetrics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensQueen's UniversitySt. Michael's HospitalAIDS VancouverMcGill University Health CentreToronto General HospitalMcMaster UniversityWomen's College HospitalUniversité LavalUniversité de MontréalWomen's Health Research InstituteWindsor Regional HospitalUniversity Health NetworkUniversity of TorontoPublic Health OntarioUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicineCervical intraepithelial neoplasiaCervical cancerVaccinationCohortHPV infectionCytologyHPV vaccinesGynecologyCancerOncologyInternal medicineImmunologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To describe prevalent and persistent oncogenic human papillomavirus (HPV) types detected in women living with HIV (WLWH) in Canada, including women with cervical dyskaryosis, and to determine predictors of type-specific HPV persistence. METHODS: Women and girls living with HIV, recruited from 14 sites of HIV care across Canada, were included in a sub-analysis of a prospective vaccine immunogenicity cohort study (two HPV DNA results, at least one cervical cytology result pre-vaccination). Demographic and clinical data were collected alongside cervical samples for cytology and HPV DNA typing between November 25, 2008, and May 19, 2015. RESULTS: Pre-vaccination, HPV16 and HPV52 were the most prevalent oncogenic HPV types. Of the 252 women and girls who met the eligibility criteria, 45% were infected with at least one oncogenic HPV type and one-third of participants had a persistent oncogenic infection. HPV16, 45, and 52 were the most frequently persistent types. Seventeen percent of women had persistent infections with oncogenic HPV types not within currently available vaccines (HPV35/39/51/56/59/68/82). Lower CD4 count significantly predicted HPV persistence (P=0.024). Cervical cytology results were normal for 82.9% of participants, atypical squamous cells of undetermined significance for 2.4%, low-grade squamous intraepithelial lesions for 11.5%, and high-grade squamous intraepithelial lesions for 2.8%. CONCLUSION: Unvaccinated WLWH were infected with a wide range of oncogenic HPV types. The findings highlighted the importance of optimal treatment of HIV and continued cervical cancer screening as key steps toward the global elimination of cervical cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,213
Score d'incertitude au seuil0,423

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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