Fluorescent Biaryl Uracils with C5-Dihydro- and Quinazolinone Heterocyclic Appendages in PNA
Notice bibliographique
Résumé
There has been much effort to exploit fluorescence techniques in the detection of nucleic acids. Canonical nucleic acids are essentially nonfluorescent; however, the modification of the nucleobase has proved to be a fruitful way to engender fluorescence. Much of the chemistry used to prepare modified nucleobases relies on expensive transition metal catalysts. In this work, we describe the synthesis of biaryl quinazolinone-uracil nucleobase analogs prepared by the condensation of anthranilamide derivatives and 5-formyluracil using inexpensive copper salts. A selection of modified nucleobases were prepared, and the effect of methoxy- or nitro- group substitution on the photophysical properties was examined. Both the dihydroquinazolinone and quinazolinone modified uracils have much larger molar absorptivity (~4–8×) than natural uracil and produce modest blue fluorescence. The quinazolinone-modified uracils display higher quantum yields than the corresponding dihydroquinazolinones and also show temperature and viscosity dependent emission consistent with molecular rotor behavior. Peptide nucleic acid (PNA) monomers possessing quinazolinone modified uracils were prepared and incorporated into oligomers. In the sequence context examined, the nitro-substituted, methoxy-substituted and unmodified quinazolinone inserts resulted in a stabilization (∆Tm = +4.0/insert; +2.0/insert; +1.0/insert, respectively) relative to control PNA sequence upon hybridization to complementary DNA. All three derivatives responded to hybridization by the “turn-on” of fluorescence intensity by ca. 3-to-4 fold and may find use as probes for complementary DNA sequences.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
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Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».