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Enregistrement W3019838317 · doi:10.1101/2020.04.24.20047845

Synaptic processes and immune-related pathways implicated in Tourette Syndrome

2020· preprint· en· W3019838317 sur OpenAlexaff
Fotis Tsetsos, Dongmei Yu, Jae Hoon Sul, Alden Y. Huang, Cornelia Illmann, Lisa Osiecki, Sabrina M. Darrow, Matthew E. Hirschtritt, Erica Greenberg, Kirsten Müller‐Vahl, Manfred Stuhrmann, Yves Dion, Guy A. Rouleau, H.N. Aschauer, M. Stamenković, Monika Schlögelhofer, Paul Sandor, Cathy L. Barr, Marco A. Grados, Harvey S. Singer, Markus M. Nöthen, Johannes Hebebrand, Anke Hinney, Robert A. King, Thomas Fernandez, Csaba Barta, Zsanett Tárnok, Péter Nagy, Christel Depienne, Yulia Worbe, Andreas Hartmann, Cathy L. Budman, Renata Rizzo, Gholson J. Lyon, William M. McMahon, James R. Batterson, Daniëlle C. Cath, Irene A. Malaty, Michael S. Okun, Cheston M. Berlin, Douglas W. Woods, Paul C. Lee, Joseph Jankovic, Mary M. Robertson, Donald L. Gilbert, Lawrence W. Brown, Barbara Coffey, Andrea Dietrich, Pieter J. Hoekstra, Samuel Kuperman, Samuel H. Zinner, Michael Wagner, James A. Knowles, A. Jeremy Willsey, Jay A. Tischfield, Gary A. Heiman, Nancy J. Cox, Nelson B. Freimer, Benjamin M. Neale, Lea K. Davis, Giovanni Coppola, Carol A. Mathews, Jeremiah M. Scharf, Peristera Paschou

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueObsessive-Compulsive Spectrum Disorders
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenSickKids FoundationUniversity of TorontoMontreal Neurological Institute and HospitalUniversity Health NetworkMcGill UniversityUniversité de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesEuropean Social FundNational Institutes of HealthState Scholarships FoundationEuropean Commission
Mots-clésTourette syndromeBiologyNeuroscienceGenome-wide association studyGeneCell adhesion moleculeSignal transductionCell adhesionConditional gene knockoutGeneticsPhenotypeCellGenotypePsychologyPsychiatrySingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Tourette Syndrome (TS) is a neuropsychiatric disorder of complex genetic architecture involving multiple interacting genes. Here, we sought to elucidate the pathways that underlie the neurobiology of the disorder through genome-wide analysis. We analyzed genome-wide genotypic data of 3581 individuals with Tourette Syndrome (TS) and 7682 ancestry-matched controls and investigated associations of TS with sets of genes that are expressed in particular cell types and operate in specific neuronal and glial functions. We employed a self-contained, set-based association method (SBA) as well as a competitive gene set method (MAGMA) using individual-level genotype data to perform a comprehensive investigation of the biological background of TS. Our SBA analysis identified three significant gene sets after Bonferroni correction, implicating Ligand-gated Ion Channel Signaling, Lymphocytic, and Cell Adhesion and Trans-synaptic Signaling processes. MAGMA analysis further supported the involvement of the Cell Adhesion and Trans-synaptic Signaling gene set. The Lympho-cytic gene set was driven by variants in FLT3 , raising an intriguing hypothesis for the involvement of a neuroinflammatory element in TS pathogenesis. The indications of involvement of Ligand-gated Ion Channel Signaling reinforce the role of GABA in TS, while the association of Cell Adhesion and Trans-synaptic Signaling gene set provides additional support for the role of adhesion molecules in neuropsychiatric disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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