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Enregistrement W3019939854 · doi:10.1038/s41587-020-0518-z

Access and benefit-sharing following the synthesis of horsepox virus

2020· article· en· W3019939854 sur OpenAlexaboutno aff
Michelle Rourke, Alexandra Phelan, Charles Lawson

Notice bibliographique

RevueNature Biotechnology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEnvironmental Futures Research Institute, Griffith UniversityGriffith UniversityCommonwealth Scientific and Industrial Research OrganisationGeorgetown University
Mots-clésGenBankGenomeSequence (biology)BiologyDNA sequencingVirusGeneticsComputational biologyGeneWorld Wide WebComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To the editor — In January 2018, PLOS ONE published the chemical synthesis of horsepox virus (HPXV) by a group of privately funded Canadian researchers. The authors state that “[s]ince HPXV may be extinct and the only specimen of HPXV that has been identified is unavailable for investigation, we explored whether HPXV could be obtained by large-scale gene synthesis.”1 The DNA sequence of the HPXV genome was published2 in 2006 and is publicly available in the US National Institutes of Health GenBank database. The Canadian researchers used the HPXV genome sequence as the digital template to ‘rematerialize’ the virus using DNA fragments ordered from a commercial provider in Germany. Viruses from the genus Orthopox have particular genetic structures (like terminal hairpin loops) that make them difficult to both sequence and reverse engineer, but the Canadian group overcame such technical difficulties using a helper virus, recreating a “faithful copy” of the HPXV template1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesIntégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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