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Enregistrement W3020250265 · doi:10.21037/tau.2020.04.05

Genetics of CFTR and male infertility

2021· review· en· W3020250265 sur OpenAlexaff
Jared M. Bieniek, Craig Lapin, Keith Jarvi

Notice bibliographique

RevueTranslational Andrology and Urology · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystic fibrosisCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorMale infertilityInfertilityBiologyGenetic testingMedicineInternal medicineGeneticsEndocrinologyPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract: Cystic fibrosis (CF) is a rare autosomal-recessive disorder manifested as multisystem organ dysfunction. The cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) protein functions as an ion transporter on the epithelium of exocrine glands, regulating secretion viscosity. The CFTR gene, encoded on chromosome 7, is required for the production and trafficking of the intact and functional CFTR protein. Literally thousands of human CFTR allelic mutations have been identified, each with varying impact on protein quality and quantity. As a result, individuals harboring CFTR mutations present with a spectrum of symptoms ranging from CF to normal phenotypes. Those with loss of function but without full CF may present with CFTR-related disorders (CFTR-RDs) including male infertility, sinusitis, pancreatitis, atypical asthma and bronchitis. Studies have demonstrated associations between higher rates of CFTR mutations and oligospermia, epididymal obstruction, congenital bilateral absence of the vas deferens (CBAVD), and idiopathic ejaculatory duct obstruction (EDO). Genetic variants are detected in over three-quarters of men with CBAVD, the reproductive abnormality most classically associated with CFTR aberrations. Likewise, nearly all men with clinical CF will have CBAVD. Current guidelines from multiple groups recommend CFTR screening in all men with clinical CF or CBAVD though a consensus on the minimum number of variants for which to test is lacking. CFTR testing is not recommended as routine screening for men with other categories of infertility. While available CFTR panels include 30 to 96 of the most common variants, complete gene sequencing should be considered if there is a high index of suspicion in a high-risk couple (e.g., partner is CFTR mutation carrier). CF treatments to date have largely targeted end-organ complications. Novel CFTR-modulator treatments aim to directly target CFTR protein dysfunction, effectively circumventing downstream complications, and possibly preventing symptoms like vasal atresia at a young age. Future gene therapies may also hold promise in preventing or reversing genetic changes that lead to CF and CFTR-RD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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