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Enregistrement W3020324838 · doi:10.1139/cjas-2019-0087

Association analysis of <i>GH1</i> and <i>CRP</i> loci polymorphisms with reproductive traits in native Pulawska gilts and sows

2020· article· en· W3020324838 sur OpenAlexvenueno aff
Marek Babicz, Marcin Pastwa, A. Kozubska‐Sobocińska, B. Danielak‐Czech, Ewa Skrzypczak, Kinga Kropiwiec-Domańska

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Animal Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal Behavior and Welfare Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeSingle-nucleotide polymorphismBiologySNPLocus (genetics)GeneticsEstrous cycleExonPolymorphism (computer science)EndocrinologyInternal medicineGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of the study was to analyse the association of growth hormone (GH1) and C-reactive protein (CRP) loci polymorphisms with reproductive traits in native Pulawska gilts and sows. In the GH1 locus, two mutations were identified: one in the second intron [single-nucleotide polymorphism (SNP) = rs340429823 in.742C>T, MspI], and one in the second exon (SNP = rs340087546 c.566G>A, HaeII). In the CRP locus, two mutations were found in exon 2 (SNP = rs340175625, NM_213844.2: c.1271A>G, BstNI; and SNP = rs80928546, NM_213844.2: c.788C>T, HinfI). Analysis of sexual activity showed that intensity of external estrus signs differed significantly (P ≤ 0.05) and was the most manifested in gilts with the CT (GH1_MspI) genotype during the second estrus. In case of the CRP gene, statistically significant differences (P ≤ 0.05) were found in terms of the duration of farrowing. The longest farrowings were reported for the GG (CRP_HinfI) and the TT (CRP_BstNI) genotypes and the shortest for the AA (CRP_HinfI) and CC (CRP_BstNI). The most numerous first litters were produced by sows with the AA genotype (CRP_HinfI), with significant differences (P ≤ 0.05) between the AA and GG genotypes. In turn, the CC homozygotes (CRP_BstNI) differed significantly (P ≤ 0.05) in terms of the number of piglets born and reared to day 21 in the second litters compared to the other genotype groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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