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Enregistrement W3020537837 · doi:10.1101/2020.04.21.052951

Nicotinamide promotes differentiation of pancreatic endocrine progenitors from human pluripotent stem cells through poly (ADP-ribose) polymerase inhibition

2020· preprint· en· W3020537837 sur OpenAlexafffund
Curtis Woodford, Ting Yin, Huntley H. Chang, Romario Regeenes, Ravi N. Vellanki, Haneesha Mohan, Bradly G. Wouters, Jonathan V. Rocheleau, Michael B. Wheeler, Peter W. Zandstra

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaPrincess Margaret Cancer CentreToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health NetworkOntario Institute for Cancer ResearchDiabetes Canada
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPDX1NicotinamideNicotinamide mononucleotideNAD+ kinaseSirtuin 1BiologyPoly ADP ribose polymeraseNiacinamideCell biologyNicotinamide phosphoribosyltransferaseChemistryBiochemistryTranscription factorNicotinamide adenine dinucleotidePolymeraseEnzymeDownregulation and upregulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The generation of pancreatic endocrine progenitor cells is an important step in the differentiation of beta cells from human pluripotent stem cells (hPSC). This stage is marked by the expression of Nkx6.1, a transcription factor with well understood downstream targets but with unclear upstream regulators. In hPSC differentiation, Nkx6.1 is strongly induced by nicotinamide, a derivative of vitamin B3, which has three known functions within a cell. Nicotinamide inhibits two classes of enzymes known as poly-ADP-ribose polymerases (PARPs) and sirtuins. It also contributes to the cellular pool of nicotinamide adenosine deoxynucleotide (NAD + ) after conversion in the nicotinamide salvage pathway. Induction of Nkx6.1 expression in pancreatic endocrine progenitors by nicotinamide was mimicked by 3 PARP inhibitors (PJ34, olaparib, NU1025). Small molecule inhibition of the nicotinamide salvage pathway reduced Nkx6.1 expression but not Pdx1 expression and caused alteration in NAD + /NADH ratio. Nkx6.1 expression was not affected by sirtuin inhibition. Metabolic profiling of differentiating pancreatic and endocrine progenitors showed that oxygen consumption increases as differentiation progresses, and that nicotinamide reduces oxygen consumption rate. Expression of Nkx6.1 and other beta cell related genes, including Ins2 and Pdx1 increased in mouse islets after exposure to nicotinamide. In summary, nicotinamide induced Nkx6.1 expression in differentiating human pancreatic endocrine progenitors through inhibition of the PARP family of enzymes. Nicotinamide administration was also associated with increased NAD+/NADH ratio, without affecting Nkx6.1 expression. Similarly, the association between nicotinamide and Nkx6.1 expression was also seen in isolated mouse islets. These observations show a link between the regulation of beta cell identity and the effectors of NAD + metabolism, suggesting possible therapeutic targets in the field of diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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