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Enregistrement W3020546315 · doi:10.1101/2020.04.17.20070086

Estimating the impact of COVID-19 control measures using a Bayesian model of physical distancing

2020· preprint· en· W3020546315 sur OpenAlexaffabout
Sean C. Anderson, Andrew M. Edwards, Madi Yerlanov, Nicola Mulberry, Jessica E. Stockdale, Sarafa A. Iyaniwura, Rebeca Cardim Falcão, Michael Otterstatter, Michael A. Irvine, Naveed Z. Janjua, Daniel Coombs, Caroline Colijn

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensBC Children's HospitalBC Centre for Disease ControlUniversity of British ColumbiaSimon Fraser UniversityUniversity of VictoriaFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSocial distanceDistancingCoronavirus disease 2019 (COVID-19)PopulationSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Bayesian probabilityEconometricsDemographyPsychologyStatisticsMedicineEnvironmental healthMathematicsDiseaseSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Extensive physical distancing measures are currently the primary intervention against coronavirus disease 2019 (COVID-19) worldwide. It is therefore urgent to estimate the impact such measures are having. We introduce a Bayesian epidemiological model in which a proportion of individuals are willing and able to participate in distancing measures, with the timing of these measures informed by survey data on attitudes to distancing and COVID-19. We fit our model to reported COVID-19 cases in British Columbia, Canada, using an observation model that accounts for both underestimation and the delay between symptom onset and reporting. We estimate the impact that physical distancing (also known as social distancing) has had on the contact rate and examine the projected impact of relaxing distancing measures. We find that distancing has had a strong impact, consistent with declines in reported cases and in hospitalization and intensive care unit numbers. We estimate that approximately 0.78 (0.66–0.89 90% CI) of contacts have been removed for individuals in British Columbia practising physical distancing and that this fraction is above the threshold of 0.45 at which prevalence is expected to grow. However, relaxing distancing measures beyond this threshold re-starts rapid exponential growth. Because the extent of underestimation is unknown, the data are consistent with a wide range in the prevalence of COVID-19 in the population; changes to testing criteria over time introduce additional uncertainty. Our projections indicate that intermittent distancing measures—if sufficiently strong and robustly followed— could control COVID-19 transmission, but that if distancing measures are relaxed too much, the epidemic curve would grow to high prevalence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,036
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,183
Score d'incertitude au seuil0,363

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,036
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,350
Tête enseignante GPT0,466
Écart entre enseignants0,116 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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