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Enregistrement W3020822728 · doi:10.2196/17176

Data Integration in the Brazilian Public Health System for Tuberculosis: Use of the Semantic Web to Establish Interoperability

2020· article· en· W3020822728 sur OpenAlexvenueno aff
Felipe Carvalho Pellison, Rui Rijo, Vinícius Lima, Nathalia Yukie Crepaldi, Filipe Andrade Bernardi, Rafael Mello Galliez, Afrânio Lineu Kritski, Kumar Abhishek, Domingos Alves

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueSemantic Web and Ontologies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésInteroperabilityComputer scienceSemantic interoperabilitySemantic WebWorld Wide WebSystem integrationData scienceKnowledge managementDatabase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Interoperability of health information systems is a challenge due to the heterogeneity of existing systems at both the technological and semantic levels of their data. The lack of existing data about interoperability disrupts intra-unit and inter-unit medical operations as well as creates challenges in conducting studies on existing data. The goal is to exchange data while providing the same meaning for data from different sources. OBJECTIVE: To find ways to solve this challenge, this research paper proposes an interoperability solution for the tuberculosis treatment and follow-up scenario in Brazil using Semantic Web technology supported by an ontology. METHODS: The entities of the ontology were allocated under the definitions of Basic Formal Ontology. Brazilian tuberculosis applications were tagged with entities from the resulting ontology. RESULTS: An interoperability layer was developed to retrieve data with the same meaning and in a structured way enabling semantic and functional interoperability. CONCLUSIONS: Health professionals could use the data gathered from several data sources to enhance the effectiveness of their actions and decisions, as shown in a practical use case to integrate tuberculosis data in the State of São Paulo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,076

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,006
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0060,006
Science ouverte0,0010,005
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,110
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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