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Enregistrement W3020937799 · doi:10.1093/cid/ciaa518

A Call for Caution in Use of Pertussis Vaccine Effectiveness Studies to Estimate Waning Immunity: A Canadian Immunization Research Network Study

2020· article· en· W3020937799 sur OpenAlexafffundabout
Natasha S. Crowcroft, Kevin L. Schwartz, Rachel Savage, Cynthia Chen, Caitlin Johnson, Ye Li, Alex Marchand‐Austin, Shelly Bolotin, Shelley L. Deeks, Frances Jamieson, Steven J. Drews, Margaret L. Russell, Lawrence W. Svenson, Kimberley Simmonds, Christiaan H. Righolt, Christopher Bell, Salaheddin M. Mahmud, Jeffrey C. Kwong

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesUniversity of AlbertaUniversity of ManitobaAlberta HealthSt Joseph's Health CentreUniversity of CalgaryInstitute for Clinical Evaluative SciencesWomen's College HospitalPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Immunization Research NetworkOntario Ministry of Health and Long-Term CarePublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésMedicineVaccinationConfoundingPertussis vaccineImmunizationVaccine efficacyImmunityPublic healthImmunologyPediatricsImmune systemInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Vaccine effectiveness (VE) studies provide essential evidence on waning vaccine-derived immunity, a major threat to pertussis control. We evaluated how study design affects estimates by comparing 2 case-control studies conducted in Ontario, Canada. METHODS: We compared results from a test-negative design (TND) with a frequency-matched design (FMD) case-control study using pertussis cases from 2005-2015. In the first study, we identified test-negative controls from the public health laboratory that diagnosed cases and, in the second, randomly selected controls from patients attending the same physicians that reported cases, frequency matched on age and year. We compared characteristics of cases and controls using standardized differences. RESULTS: In both designs, VE estimates for the early years postimmunization were consistent with clinical trials (TND, 84%; FMD, 89% at 1-3 years postvaccination) but diverged as time since last vaccination increased (TND, 41%; FMD, 74% by 8 years postvaccination). Overall, we observed lower VE and faster waning in the TND than the FMD. In the TND but not FMD, controls differed from cases in important confounders, being younger, having more comorbidities, and higher healthcare use. Differences between the controls of each design were greater than differences between cases. TND controls were more likely to be unvaccinated or incompletely vaccinated than FMD controls (P < .001). CONCLUSIONS: The FMD adjusted better for healthcare-seeking behavior than the TND. Duration of protection from pertussis vaccines is unclear because estimates vary by study design. Caution should be exercised by experts, researchers, and decision makers when evaluating evidence on optimal timing of boosters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,575
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,711
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,425
Score d'incertitude au seuil0,611

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,5750,711
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0100,007
Bibliométrie0,0130,015
Études des sciences et des technologies0,0080,013
Communication savante0,0130,006
Science ouverte0,0170,005
Intégrité de la recherche0,0080,013
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,198
Tête enseignante GPT0,470
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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