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Enregistrement W3021119075 · doi:10.1097/cmr.0000000000000668

MC1R variants and cutaneous melanoma risk according to histological type, body site, and Breslow thickness: a pooled analysis from the M-SKIP project

2020· article· en· W3021119075 sur OpenAlexaff
Saverio Caini, Sara Gandini, Francesca Botta, Elena Tagliabue, Sara Raimondi, Eduardo Nagore, Ines Zanna, Patrick Maisonneuve, Julia Newton‐Bishop, David Polsky, DeAnn Lazovich, Rajiv Kumar, Peter A. Kanetsky, Veronica Höiom, Paola Ghiorzo, Maria Teresa Landi, Gloría Ribas, Chiara Menin, Alexander Stratigos, Giuseppe Palmieri, Gabriella Guida, José C. García‐Borrón, Hongmei Nan, Julian Little, Francesco Sera, Susana Puig, Maria Concetta Fargnoli

Notice bibliographique

RevueMelanoma Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCutaneous Melanoma Detection and Management
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCancer Research UK
Mots-clésBreslow ThicknessMelanomaDermatologyMedicineType (biology)Internal medicineBiologyCancerCancer researchPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Little is known on whether melanocortin 1 receptor (MC1R) associated cutaneous melanoma (CM) risk varies depending on histological subtype and body site, and whether tumour thickness at diagnosis (the most important prognostic factor for CM patients) differs between MC1R variant carriers and wild-type individuals. We studied the association between MC1R variants and CM risk by histological subtype, body site, and Breslow thickness, using the database of the M-SKIP project. We pooled individual data from 15 case-control studies conducted during 2005-2015 in Europe and the USA. Study-specific, multi-adjusted odds ratios were pooled into summary odds ratios (SOR) and 95% confidence intervals (CI) using random-effects models. Six thousand eight hundred ninety-one CM cases and 5555 controls were included. CM risk was increased among MC1R variant carriers vs. wild-type individuals. The increase in risk was comparable across histological subtypes (SOR for any variant vs. wild-type ranged between 1.57 and 1.70, always statistical significant) except acral lentiginous melanoma (ALM), for which no association emerged; and slightly greater on chronically (1.74, 95% CI 1.47-2.07) than intermittently (1.55, 95% CI 1.34-1.78) sun-exposed skin. CM risk was greater for those carrying 'R' vs. 'r' variants; correlated with the number of variants; and was more evident among individuals not showing the red hair colour phenotype. Breslow thickness was not associated with MC1R status. MC1R variants were associated with an increased risk of CM of any histological subtype (except ALM) and occurring on both chronically and intermittently sun-exposed skin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,013
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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