The utility of chemical signals as phylogenetic characters: an example from the Felidae
Notice bibliographique
Résumé
Chemical secretions that are explicitly tied to species recognition may potentially be informative for phylogenetic reconstruction, especially when traditional morphological or molecular characters lack resolution. Anal sac secretions from 16 species within the family Felidae (order Carnivora) were chemically analysed and their utility as phylogenetic characters was assessed. Results were generally consistent across the different chemical data types (e.g. glycolipids, neutral lipids, or phospholipids). Two major clades were indicated, falling out according to body size: one for species greater than 30 kg (Panthera, Uncia, and Puma) and another for those less than 12 kg (remaining species). The primary solutions agreed with respect to the species pairs Prionailurus + Leptailurus, Caracal+Lynx, Oncifelis+Leopardus, Otocolobus+Felis, Panthera leo + P pardus, and P. tigris + Uncia. The only area of disagreement between chemical types was the positioning of the mountain lion (Puma concolor); however, this species appears to cluster with the cheetah (Acinonyx jubatus) in the Tjig cat clade. Although our solutions differ from six previously proposed hypotheses of felid phylogeny (morphological and molecular), the previous estimates all differ strongly amongst themselves reflecting the historical uncertainty regarding felid systematics. Phytogenies derived from the lipid data were very robust and decisive. Few equally most parsimonious trees were obtained, consistency indices were much higher than their expected values, and bootstrap and Bremer support values were also high. Thus, our findings illustrate the species-specific nature of chemical signals and their usefulness as phylogenetic characters.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».