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Enregistrement W3021801919 · doi:10.7554/elife.55692.sa2

Author response: The antibiotic bedaquiline activates host macrophage innate immune resistance to bacterial infection

2020· peer-review· en· W3021801919 sur OpenAlexaboutno aff
Alexandre Giraud-Gatineau, Juan Manuel Coya, Alexandra Maure, Anne Biton, M. Thomson, Elliott M. Bernard, Jade Marrec, Maximiliano G. Gutiérrez, Gerald Larrouy‐Maumus, Roland Brosch, Brigitte Gicquel, Ludovic Tailleux

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBedaquilineAntibioticsBiologyMicrobiologyImmune systemInnate immune systemBacteriaAntimicrobialAntibiotic resistanceTuberculosisIntracellular parasiteGeneMycobacterium tuberculosisImmunologyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The discovery of antibiotic drugs, which treat diseases caused by bacteria, has been a hugely valuable advance in modern medicine. They work by targeting specific cellular processes in bacteria, ultimately stopping them from multiplying or killing them outright. Antibiotics sometimes also affect their human hosts and can cause side-effects, such as gut problems or skin reactions. Recent evidence suggests that antibiotics also have an impact on the human immune system. This may happen either indirectly, by affecting ‘friendly’ bacteria normally present in the body, or through direct effects on immune cells. In turn, this could change the effectiveness of drug treatments. For example, if an antibiotic weakens immune cells, the body could have difficulty fighting off the existing infection – or become more vulnerable to new ones. However, even though new drugs are being introduced to combat the worldwide rise of antibiotic-resistant bacteria, their effects on immunity are still not well understood. For example, bedaquiline is an antibiotic recently developed to treat tuberculosis infections that are resistant to several drugs. Giraud-Gatineau et al. wanted to determine if bedaquiline altered the human immune response to bacterial infection independently from its direct anti-microbial effects. Macrophages engulf foreign particles like bacteria and break them down using enzymes stored within small internal compartments, or ‘lysosomes’. Initial experiments using human macrophages, grown both with and without bedaquiline, showed that the drug did not harm the cells and that they grew normally. A combination of microscope imaging and genetic analysis revealed that exposure to bedaquiline not only increased the number of lysosomes within macrophage cells, but also the activity of genes and proteins that increase lysosomes’ ability to break down foreign particles. These results suggested that bedaquiline treatment might make macrophages better at fighting infection, even if the drug itself had no direct effect on bacterial cells. Further studies, where macrophages were first treated with bedaquiline and then exposed to different types of bacteria known to be resistant to the drug, confirmed this hypothesis: in every case, the treated macrophages became efficient bacterial killers. In contrast, older anti-tuberculosis drugs did not have any such potentiating effect on the macrophages. This work sheds new light on our how antibiotic drugs can interact with the cells of the human immune system, and can sometimes even boost our innate defences. Such immune-boosting effects could one day be exploited to make more effective treatments against bacterial infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,298
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2980,116

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,388
Écart entre enseignants0,338 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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