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Enregistrement W3021867103 · doi:10.1016/j.cytogfr.2020.03.001

Interferon, restriction factors and SUMO pathways

2020· review· en· W3021867103 sur OpenAlexaff
Faten El-Asmi, Francis P. McManus, Pierre Thibault, Mounira K. Chelbi‐Alix

Notice bibliographique

RevueCytokine & Growth Factor Reviews · 2020
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversité du Québec à MontréalInstitute for Research in Immunology and CancerUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la RechercheStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésSUMO proteinUbiquitin ligaseBiologyCrosstalkUbiquitinInterferonCell biologySUMO enzymesSignal transductionCullinGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMOylation is a reversible post-translational modification that regulates several cellular processes including protein stability, subcellular localization, protein-protein interactions and plays a key role in the interferon (IFN) pathway and antiviral defense. In human, three ubiquitously expressed SUMO paralogs (SUMO1, 2 and 3) have been described for their implication in both intrinsic and innate immunity. Differential effects between SUMO paralogs are emerging such as their distinctive regulations of IFN synthesis, of IFN signaling and of the expression and function of IFN-stimulated gene (ISG) products. Several restriction factors are conjugated to SUMO and their modifications are further enhanced in response to IFN. Also, IFN itself was shown to increase global cellular SUMOylation and requires the presence of the E3 SUMO ligase PML that coordinates the assembly of PML nuclear bodies. This review focuses on differential effects of SUMO paralogs on IFN signaling and the stabilization/destabilization of ISG products, highlighting the crosstalk between SUMOylation and other post-translational modifications such as ubiquitination and ISGylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,988
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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