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Enregistrement W3022047469 · doi:10.1266/ggs.19-00008

Nutritional conditions and oxygen concentration affect spontaneous occurrence of homologous recombination events but not spontaneous mutagenesis in <i>Escherichia coli</i>

2020· article· en· W3022047469 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenes & Genetic Systems · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsKeio University
Mots-clésHomologous recombinationEscherichia coliBiologyMutagenesisMutation frequencyRecombinationDNAMutationDNA repairMolecular biologyStrain (injury)Wild typeDNA damageBiochemistryGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Effects of environmental factors for growth of Escherichia coli on spontaneous mutagenesis and homologous recombination events are described. By analyzing rifampicin-resistant (Rifr) mutation frequencies in an E. coli strain lacking MutM and MutY repair enzymes, which suppress base substitution mutations caused by 8-oxoguanine (7,8 dihydro-8-oxoguanine; 8-oxoG) in DNA, we examined levels of oxidative DNA damage produced in normally growing cells. The level of 8-oxoG DNA damage was about 9- and 63-fold higher in cells grown in M9-glucose and M9-glycerol media, respectively, than in those grown in LB medium. We also found that about 14-fold more 8-oxoG DNA damage was produced in cells grown in about 0.1% oxygen than in those grown in the normal atmosphere. However, Rifr mutation frequency in wild-type cells was unchanged in such different growth conditions, suggesting that the capacity of repair mechanisms is sufficient to suppress mutations caused by 8-oxoG even at very high levels in cells growing in the particular conditions. On the other hand, the frequency of spontaneous homologous recombination events in wild-type E. coli cells varied with different growth conditions. When cells were grown in M9-glucose and M9-glycerol media, the spontaneous recombination frequency increased to about 4.3- and 7.3-fold, respectively, higher than that in LB medium. Likewise, the spontaneous recombination frequency was about 3.5-fold higher in cells growing in the hypoxic condition than in cells growing in the atmosphere. When cells were grown in anaerobic conditions, the recombination frequency decreased to half of that in the atmosphere. These data indicated that spontaneous homologous recombination is highly responsive to environmental factors such as nutrition and oxygen concentration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle