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Enregistrement W3022090653 · doi:10.1002/jimd.12248

A biallelic pathogenic variant in the <scp><i>OGDH</i></scp> gene results in a neurological disorder with features of a mitochondrial disease

2020· article· en· W3022090653 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Inherited Metabolic Disease · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstitutePresbyterian Health Foundation
Mots-clésMitochondrial diseaseGeneDiseaseGeneticsMitochondrionMetabolic diseaseBiologyMedicineMitochondrial DNAEndocrinologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract 2‐Oxoglutarate dehydrogenase (OGDH) is a rate‐limiting enzyme in the mitochondrial TCA cycle, encoded by the OGDH gene. α‐Ketoglutarate dehydrogenase (OGDH) deficiency was previously reported in association with developmental delay, hypotonia, and movement disorders and metabolic decompensation, with no genetic data provided. Using whole exome sequencing, we identified two individuals carrying a homozygous missense variant c.959A&gt;G (p.N320S) in the OGDH gene. These individuals presented with global developmental delay, elevated lactate, ataxia and seizure. Fibroblast analysis and modeling of the mutation in Drosophila were used to evaluate pathogenicity of the variant. Skin fibroblasts from subject # 2 showed a decrease in both OGDH protein and enzyme activity. Transfection of human OGDH cDNA in HEK293 cells carrying p.N320S also produced significantly lower protein levels compared to those with wild‐type cDNA. Loss of Drosophila Ogdh ( dOgdh ) caused early developmental lethality, rescued by expressing wild‐type dOgdh ( dOgdh WT ) or human OGDH ( OGDH WT ) cDNA. In contrast, expression to the mutant OGDH ( OGDH N320S ) or dOgdh carrying homologous mutations to human OGDH p.N320S variant ( dOgdh N324S ) failed to rescue lethality of dOgdh null mutants. Knockdown of dOgdh in the nervous system resulted in locomotion defects which were rescued by dOgdh WT expression but not by dOgdh N324S expression. Collectively, the results indicate that c.959A&gt;G variant in OGDH leads to an amino acid change (p.N320S) causing a severe loss of OGDH protein function. Our study establishes in the first time a genetic link between an OGDH gene mutation and OGDH deficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,873
Score d'incertitude au seuil0,613

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle