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Enregistrement W3022121486 · doi:10.2196/17329

Exploring the Paradoxical Relationship of a Creb 3 Regulatory Factor Missense Variant With Body Mass Index and Diabetes Among Samoans: Protocol for the Soifua Manuia (Good Health) Observational Cohort Study

2020· article· en· W3022121486 sur OpenAlexvenueno aff
Nicola L. Hawley, Alysa Pomer, Anna C. Rivara, Samantha L. Rosenthal, Rachel L. Duckham, Jenna C. Carlson, Take Naseri, Muagututi‘a Sefuiva Reupena, Melania Selu, Vaimoana Lupematisila, Folla Unasa, Lupesina Vesi, Tracy Fatu, Seipepa Unasa, Kima Faasalele‐Savusa, Abigail Wetzel, Christina Soti‐Ulberg, Angela T. Prescott, Gloria Siufaga, Corina Penaia, Sophie B. To, Lauren C. LaMonica, Viali Lameko, Courtney C. Choy, Scott E. Crouter, Susan Redline, Ranjan Deka, Erin E. Kershaw, Zsolt Urbán, Ryan L. Minster, Daniel E. Weeks, Stephen T. McGarvey

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesFogarty International CenterNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of PittsburghBrown University
Mots-clésMedicineBody mass indexAnthropometryOverweightObesityBioelectrical impedance analysisCohortCohort studyGerontologyInternal medicineDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The prevalence of obesity and diabetes in Samoa, like many other Pacific Island nations, has reached epidemic proportions. Although the etiology of these conditions can be largely attributed to the rapidly changing economic and nutritional environment, a recently identified genetic variant, rs373863828 (CREB 3 regulatory factor, CREBRF: c.1370G>A p.[R457Q]) is associated with increased odds of obesity, but paradoxically, decreased odds of diabetes. OBJECTIVE: The overarching goal of the Soifua Manuia (Good Health) study was to precisely characterize the association of the CREBRF variant with metabolic (body composition and glucose homeostasis) and behavioral traits (dietary intake, physical activity, sleep, and weight control behaviors) that influence energy homeostasis in 500 adults. METHODS: A cohort of adult Samoans who participated in a genome-wide association study of adiposity in Samoa in 2010 was followed up, based on the presence or absence of the CREBRF variant, between August 2017 and March 2019. Over a period of 7-10 days, each participant completed the main study protocol, which consisted of anthropometric measurements (weight, height, circumferences, and skinfolds), body composition assessment (bioelectrical impedance and dual-energy x-ray absorptiometry), point-of-care glycated hemoglobin measurement, a fasting blood draw and oral glucose tolerance test, urine collection, blood pressure measurement, hand grip strength measurement, objective physical activity and sleep apnea monitoring, and questionnaire measures (eg, health interview, cigarette and alcohol use, food frequency questionnaire, socioeconomic position, stress, social support, food and water insecurity, sleep, body image, and dietary preferences). In January 2019, a subsample of the study participants (n=118) completed a buttock fat biopsy procedure to collect subcutaneous adipose tissue samples. RESULTS: Enrollment of 519 participants was completed in March 2019. Data analyses are ongoing, with results expected in 2020 and 2021. CONCLUSIONS: While the genetic variant rs373863828, in CREBRF, has the largest known effect size of any identified common obesity gene, very little is currently understood about the mechanisms by which it confers increased odds of obesity but paradoxically lowered odds of type 2 diabetes. The results of this study will provide insights into how the gene functions on a whole-body level, which could provide novel targets to prevent or treat obesity, diabetes, and associated metabolic disorders. This study represents the human arm of a comprehensive and integrated approach involving humans as well as preclinical models that will provide novel insights into metabolic disease. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): RR1-10.2196/17329.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,389

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,418
Tête enseignante GPT0,483
Écart entre enseignants0,065 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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