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Enregistrement W3022210151 · doi:10.1182/blood.2019002548

The EMT modulator SNAI1 contributes to AML pathogenesis via its interaction with LSD1

2020· article· en· W3022210151 sur OpenAlexaff
Catherine Carmichael, Jueqiong Wang, Thao M. Nguyen, Oluseyi Kolawole, Aissa Benyoucef, Charlotte De Mazière, Anna R. Milne, Sona Samuel, Kevin R. Gillinder, Soroor Hediyeh-zadeh, Anh Vo, Yizhou Huang, Kathy Knezevic, William R. L. McInnes, Benjamin J. Shields, H. L. Mitchell, Matthew E. Ritchie, Tim Lammens, Béatrice Lintermans, Pieter Van Vlierberghe, Nicholas C. Wong, Katharina Haigh, Julie A.I. Thoms, Emma Toulmin, David J. Curtis, Ethan P. Oxley, Ross A. Dickins, Dominik Beck, Andrew C. Perkins, Matthew P. McCormack, Melissa J. Davis, Geert Berx, Johannes Zuber, John E. Pimanda, Benjamin T. Kile, Steven Goossens, Jody J. Haigh

Notice bibliographique

RevueBlood · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of ManitobaResearch Institute in Oncology and HematologyCancerCare Manitoba
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilTranslational Cancer Research NetworkFondation contre le CancerNational Health and Medical Research CouncilVlaamse regeringUniversiteit GentEuropean Hematology AssociationCancer Institute NSWMonash UniversityFonds Wetenschappelijk OnderzoekNSW Health Pathology
Mots-clésSNAI1Myeloid leukemiaLeukemiaCancer researchBiologyEpithelial–mesenchymal transitionEctopic expressionPathogenesisDemethylaseHaematopoiesisImmunologyHistoneStem cellCancerCell biologyGeneticsCell cultureGeneMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Modulators of epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) have recently emerged as novel players in the field of leukemia biology. The mechanisms by which EMT modulators contribute to leukemia pathogenesis, however, remain to be elucidated. Here we show that overexpression of SNAI1, a key modulator of EMT, is a pathologically relevant event in human acute myeloid leukemia (AML) that contributes to impaired differentiation, enhanced self-renewal, and proliferation of immature myeloid cells. We demonstrate that ectopic expression of Snai1 in hematopoietic cells predisposes mice to AML development. This effect is mediated by interaction with the histone demethylase KDM1A/LSD1. Our data shed new light on the role of SNAI1 in leukemia development and identify a novel mechanism of LSD1 corruption in cancer. This is particularly pertinent given the current interest surrounding the use of LSD1 inhibitors in the treatment of multiple different malignancies, including AML.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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