Selection of viral variants during persistent infection of insectivorous bat cells with Middle East respiratory syndrome coronavirus
Notice bibliographique
Résumé
Coronaviruses that cause severe acute respiratory syndrome (SARS) and Middle East respiratory syndrome (MERS) are speculated to have originated in bats. The mechanisms by which these viruses are maintained in individuals or populations of reservoir bats remain an enigma. Mathematical models have predicted long-term persistent infection with low levels of periodic shedding as a likely route for virus maintenance and spillover from bats. In this study, we tested the hypothesis that bat cells and MERS coronavirus (CoV) can co-exist in vitro. To test our hypothesis, we established a long-term coronavirus infection model of bat cells that are persistently infected with MERS-CoV. We infected cells from Eptesicus fuscus with MERS-CoV and maintained them in culture for at least 126 days. We characterized the persistently infected cells by detecting virus particles, protein and transcripts. Basal levels of type I interferon in the long-term infected bat cells were higher, relative to uninfected cells, and disrupting the interferon response in persistently infected bat cells increased virus replication. By sequencing the whole genome of MERS-CoV from persistently infected bat cells, we identified that bat cells repeatedly selected for viral variants that contained mutations in the viral open reading frame 5 (ORF5) protein. Furthermore, bat cells that were persistently infected with ΔORF5 MERS-CoV were resistant to superinfection by wildtype virus, likely due to reduced levels of the virus receptor, dipeptidyl peptidase 4 (DPP4) and higher basal levels of interferon in these cells. In summary, our study provides evidence for a model of coronavirus persistence in bats, along with the establishment of a unique persistently infected cell culture model to study MERS-CoV-bat interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».