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Enregistrement W3022586452 · doi:10.1371/journal.pone.0231948

Grifolin, neogrifolin and confluentin from the terricolous polypore Albatrellus flettii suppress KRAS expression in human colon cancer cells

2020· article· en· W3022586452 sur OpenAlexafffund
Almas Yaqoob, Wai Ming Li, Victor Liu, Chuyi Wang, Sebastian Mackedenski, Linda E. Tackaberry, Hugues B. Massicotte, Keith N. Egger, Kerry B. Reimer, Chow H. Lee

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Biology and Applications
Établissements canadiensUniversity of Northern British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Foundation for InnovationUniversity of Northern British Columbia
Mots-clésKRASViability assayBiologyCell cycle checkpointCell cultureApoptosisChemistryMolecular biologyCell cycleCancer researchColorectal cancerBiochemistryCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In our search for bioactive mushrooms native to British Columbia, we determined that the ethanol extracts from fruiting bodies of the terrestrial polypore Albatrellus flettii had potent anti-cell viability activity. Using bioassay-guided fractionation, mass spectrometry and nuclear magnetic resonance, we successfully isolated three known compounds (grifolin, neogrifolin and confluentin). These compounds represent the major anti-cell viability components from the ethanol extracts of A. flettii. We also identified a novel biological activity for these compounds, specifically in down-regulating KRAS expression in two human colon cancer cell lines. Relatively little is known about the anti-cell viability activity and mechanism of action of confluentin. For the first time, we show the ability of confluentin to induce apoptosis and arrest the cell cycle at the G2/M phase in SW480 human colon cancer cells. The oncogenic insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 (IMP1) has been previously shown to regulate KRAS mRNA expression in colon cancer cells, possibly through its ability to bind to the KRAS transcript. Using a fluorescence polarization assay, we show that confluentin dose-dependently inhibits the physical interaction between KRAS RNA and full-length IMP1. The inhibition also occurs with truncated IMP1 containing the KH1 to KH4 domain (KH1to4 IMP1), but not with the di-domain KH3 and KH4 (KH3&4 IMP1). In addition, unlike the control antibiotic neomycin, grifolin, neogrifolin and confluentin do not bind to KRAS RNA. These results suggest that confluentin inhibits IMP1-KRAS RNA interaction by binding to the KH1&2 di-domains of IMP1. Since the molecular interaction between IMP1 and its target RNAs is a pre-requisite for the oncogenic function of IMP1, confluentin should be further explored as a potential inhibitor of IMP1 in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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