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Enregistrement W3022826378 · doi:10.3920/wmj2019.2532

Fusarium graminearum populations from maize and wheat in Ontario, Canada

2020· article· en· W3022826378 sur OpenAlexaffabout
Trinda Crippin, Victor Limay‐Rios, Justin B. Renaud, A. W. Schaafsma, Mark W. Sumarah, J. David Miller

Notice bibliographique

RevueWorld Mycotoxin Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of GuelphCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemotypeFusariumTrichotheceneBiologyMycotoxinGibberella zeaeGibberellaGenotypePopulationVomitoxinVeterinary medicineAgronomyHorticultureZearalenoneBotanyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ontario has suffered widespread epidemics ofFusarium Head Blight orGibberella Ear Rot roughly every five years since the late 1970s. We undertook a study of the chemotype and genotype ofFusarium graminearum isolated from 1,800 samples of wheat and maize collected across the cereal growing areas over three years. 468 isolates obtained were genotyped and 60 were selected for chemotyping. The dominant genotype has remained the native 15-acetyldeoxynivalenol (15-ADON) population. Approximately 20% of the strains tested were of the native chemotype producing only 15-ADON and one strain producing solely 7α-hydroxy,15-deacetylcalonectrin (3ANX) was observed. The majority of the 15-ADON strains were also capable of producing 3ANX. There was consistent mismatch between chemotype and genotype. This reflects the considerable plasticity in the genes associated with trichothecene biosynthesis documented in severalFusarium species. Although there is a large gradient in climate from southern to eastern Ontario, we did not detect differences in the distribution of the chemotypes. Grain from which strains were isolated for chemotyping were analysed. Approximately half of the 53 samples had >2 mg/kg deoxynivalenol with a maximum of 400 mg/kg and median of 14 mg/kg. 7α-hydroxy,3,15-dideacetylcalonectrin (NX toxin) was detected in three of these samples at an average of 4.5 mg/kg. The stability of theF. graminearum genotype in Ontario can be explained by several factors. Since 1980, the area planted to maize has remained stable, however, the area given to wheat has about doubled. Minimum tillage was rare in 1980 but it is now the norm. Increased crop residue on the soil has greatly increased the biomass of ascocarps that overwinter. Overall, these data demonstrate the need to monitor the mycotoxins inFusarium populations and for the need to consider the potential toxicity of NX in the feed supply.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,146

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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