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Enregistrement W3022949607 · doi:10.3389/fimmu.2020.00841

Opposing Roles for the Related ETS-Family Transcription Factors Spi-B and Spi-C in Regulating B Cell Differentiation and Function

2020· article· en· W3022949607 sur OpenAlexafffund
Anne-Sophie Laramée, Hannah L. Raczkowski, Peng Shao, Carolina R. Batista, Devanshi Shukla, Li Xu, S.M. Mansour Haeryfar, Yodit Tesfagiorgis, Steven M. Kerfoot, Rodney P. DeKoter

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensChildren’s Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésB cellPlasma cellBiologyGerminal centerTranscription factorCell biologyAntibodyCellular differentiationCellPAX5Molecular biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Generation of specific antibodies during an immune response to infection or vaccination depends on the ability to rapidly and accurately select clones of antibody-secreting B lymphocytes for expansion. Antigen-specific B cell clones undergo the cell fate decision to differentiate into antibody-secreting plasma cells, memory B cells, or germinal center B cells. The E26-transformation-specific (ETS) transcription factors Spi-B and Spi-C are important regulators of B cell development and function. Spi-B is expressed throughout B cell development and is downregulated upon plasma cell differentiation. Spi-C is highly related to Spi-B and has similar DNA-binding specificity. Heterozygosity for Spic rescues B cell development and B cell proliferation defects observed in Spi-B knockout mice. In this study, we show that heterozygosity for Spic rescued defective secondary antibody responses in Spib-/- mice. Plasma cell differentiation was accelerated in Spib-/- B cells. Gene expression, ChIP-seq, and reporter gene analysis showed that Spi-B and Spi-C differentially regulated Bach2, encoding a key regulator of plasma cell and memory B cell differentiation. These results suggest that Spi-B and Spi-C oppose the function of one another to regulate B cell differentiation and function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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