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Enregistrement W3023046164 · doi:10.1101/2020.05.04.077115

A Second Generation Leishmanization Vaccine with a Markerless Attenuated <i>Leishmania major</i> Strain using CRISPR gene editing

2020· preprint· en· W3023046164 sur OpenAlexafffund
Wen‐Wei Zhang, Subir Karmakar, Sreenivas Gannavaram, Ranadhir Dey, Patrick Lypaczewski, Nevien Ismail, Abid Siddiqui, Vahan Simonyan, Fabiano Oliveira, Iliano V. Coutinho-Abreu, Thiago DeSouza‐Vieira, Claudio Meneses, James Oristian, Tiago D. Serfim, Abu Musa, Risa Nakamura, Noushin Saljoughian, Greta Volpedo, Monika Satoskar, Sanika Satoskar, Pradeep K. Dagur, J. Philip McCoy, Shaden Kamhawi, Jesús G. Valenzuela, Shinjiro Hamano, Abhay R. Satoskar, Greg Matlashewski, Hira L. Nakhasi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGlobal Health Innovative Technology Fund
Mots-clésLeishmaniaCRISPRBiologyGenome editingImmune systemLeishmania majorCutaneous leishmaniasisLeishmaniasisVaccinationVirologyVector (molecular biology)Attenuated vaccineImmunizationStrain (injury)GeneTropical diseaseImmunologyMicrobiologyDiseaseParasite hostingMedicineGeneticsVirulenceRecombinant DNAPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Leishmaniasis is a debilitating and often fatal neglected tropical disease caused by Leishmania protozoa transmitted by infected sand flies. Vaccination through leishmanization with live Leishmania major has been used successfully but is no longer practiced because it resulted in unacceptable skin lesions. A second generation leishmanization is described here using a CRISPR genome edited L. major strain ( LmCen -/- ). Notably, LmCen -/- is the first genetically engineered gene deleted Leishmania strain that is antibiotic resistant marker free and does not have any off-target mutations. Mice immunized with LmCen -/- had virtually no visible lesions following challenge with L. major -infected sand flies while non-immunized animals developed large and progressive lesions with a 2-log fold higher parasite burden. LmCen -/- immunization showed protection and an immune response comparable to leishmanization. LmCen -/- is safe since it was unable to cause disease even in immunocompromised mice, induces robust host protection against vector sand fly challenge and because it is marker free, can be advanced to human vaccine trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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